RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 RNF146Q9NTX7 359 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 FANCLQ9NW38 375 aa7.16□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 IFNKQ9P0W0 207 aa7.16□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 RIPK3Q9Y572 518 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 MAST4O15021 2626 aa7.16□□□□□ -1.26
CCL20-202ENST00000409189 ITIH6Q6UXX5 1313 aa7.16□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 CHST13Q8NET6 341 aa7.15□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 COL20A1Q9P218 1284 aa7.15□□□□□ -1.26
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CCL20-202ENST00000409189 TSG101Q99816 390 aa7.14□□□□□ -1.27
CCL20-202ENST00000409189 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.14□□□□□ -1.27
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