RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407684.1

GAREM2-202, Transcript of GRB2 associated regulator of MAPK1 subtype 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GAREM2, Length 5,138 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAREM2-202ENST00000407684 NPHS2Q9NP85 383 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 ADA2Q9NZK5 511 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 SLC13A4Q9UKG4 626 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 CA12O43570 354 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 RAB27AP51159 221 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 PDK1Q15118 436 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 C4orf22Q6V702 233 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 FAM129AQ9BZQ8 928 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 PIDD1Q9HB75 910 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 ENO4A6NNW6 628 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 UGP2Q16851 508 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 GLRA4Q5JXX5 417 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 TISP43B9A030 160 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 FAM107AO95990 144 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 PYGBP11216 843 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 IFNA8P32881 189 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 SERPINB9P50453 376 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 BOLA3Q53S33 107 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 CYP4A22Q5TCH4 519 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 IFNL1Q8IU54 200 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 ATPAF2Q8N5M1 289 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 SIK3Q9Y2K2 1263 aa18.04■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 MMP3P08254 477 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 ERFP50548 548 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 PTENP60484 403 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 MYL6P60660 151 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 GCNT1Q02742 428 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 SPIRE1Q08AE8 756 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 PTK7Q13308 1070 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 PTGISQ16647 500 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 NFIL3Q16649 462 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 ACCSLQ4AC99 568 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 LDLRAD1Q5T700 205 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 GRAMD4Q6IC98 578 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 UBA3Q8TBC4 463 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 ING2Q9H160 280 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 TGFB1I1O43294 461 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 MTM1Q13496 603 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 SNX17Q15036 470 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 CXCL17Q6UXB2 119 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 HACD3Q9P035 362 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 OPLAHO14841 1288 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 CYP11B1P15538 503 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 MIIPQ5JXC2 388 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 GZMAP12544 262 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 PGM1P36871 562 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 KAT2BQ92831 832 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 TRIM54Q9BYV2 358 aa18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 RASSF10A6NK89 507 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 IMPG1Q17R60 797 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 RABGAP1LQ5R372 815 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 TTC23LQ6PF05 361 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 NCLNQ969V3 563 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 USP20Q9Y2K6 914 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 MARSP56192 900 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 KDSRQ06136 332 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 TAS2R42Q7RTR8 314 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 TXNRD2Q9NNW7 524 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 SNTG2Q9NY99 539 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 BRWD3Q6RI45 1802 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 LAMB3Q13751 1172 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 DCAF6Q58WW2 860 aa18.02■□□□□ 0.48
GAREM2-202ENST00000407684 MTSS1O43312 755 aa18.02■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 PGK1P00558 417 aa18.02■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 CYBBP04839 570 aa18.02■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 OCA2Q04671 838 aa18.02■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 CUL3Q13618 768 aa18.02■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 TBCCQ15814 346 aa18.02■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 KDELC2Q7Z4H8 507 aa18.02■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 RREB1Q92766 1687 aa18.02■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 EGFL8Q99944 293 aa18.02■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 E2F6O75461 281 aa18.01■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 FAM200BP0CF97 657 aa18.01■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 STX3Q13277 289 aa18.01■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 C16orf87Q6PH81 154 aa18.01■□□□□ 0.47
GAREM2-202ENST00000407684 ICA1LQ8NDH6 482 aa18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms