RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 USP3Q9Y6I4 520 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 TECTAO75443 2155 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 ECI2O75521 394 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 SOX5P35711 763 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 AVPR1AP37288 418 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 BPIFB4P59827 614 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 TANGO2Q6ICL3 276 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 DENND1BQ6P3S1 775 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 CCDC186Q7Z3E2 898 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 ELSPBP1Q96BH3 223 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 SLC22A12Q96S37 553 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 DCXO43602 365 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 GFPT2O94808 682 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 PBX1P40424 430 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 VIPR2P41587 438 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 GPD2P43304 727 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 RGS7P49802 495 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 PDE6CP51160 858 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 TKTL1P51854 596 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 ADIGQ0VDE8 80 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 TDGQ13569 410 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 PMF1Q6P1K2 205 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 OLFM2O95897 454 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 ABL1P00519 1130 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 CKMP06732 381 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 CYP11B1P15538 503 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 PFKLP17858 780 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 STAT1P42224 750 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 PGFP49763 221 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 TUBP50607 506 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 VITQ6UXI7 678 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 CYTH4Q9UIA0 394 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 CCL26Q9Y258 94 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 GABBR2O75899 941 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 USP17L7P0C7H9 530 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 PASD1Q8IV76 773 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 BAP1Q92560 729 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 E2F7Q96AV8 911 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 HSFY1Q96LI6 401 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 NMUR1Q9HB89 426 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 TDP1Q9NUW8 608 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 OBP2AQ9NY56 170 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 A0A1W2PQH9 124 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 NARSO43776 548 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 ZBED1O96006 694 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 LCP1P13796 627 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 HDCP19113 662 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 KRT9P35527 623 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 HECTD3Q5T447 861 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 TAF3Q5VWG9 929 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 SCD5Q86SK9 330 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 SCML4Q8N228 414 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 STK32AQ8WU08 396 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 OSER1Q9NX31 292 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 COL4A3Q01955 1670 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXD12-202ENST00000406506 PIK3R2O00459 728 aa20.27■□□□□ 0.83
HOXD12-202ENST00000406506 DPYSL4O14531 572 aa20.27■□□□□ 0.83
HOXD12-202ENST00000406506 COCHO43405 550 aa20.27■□□□□ 0.83
HOXD12-202ENST00000406506 TLR5O60602 858 aa20.27■□□□□ 0.83
HOXD12-202ENST00000406506 TPM3P06753 285 aa20.27■□□□□ 0.83
HOXD12-202ENST00000406506 PSEN1P49768 467 aa20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms