RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 KCNJ11Q14654 390 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 DPH6Q7L8W6 267 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 CEP57Q86XR8 500 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 H7C0C1 242 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ATP5OP48047 213 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 SNX16P57768 344 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 SPDYAQ5MJ70 313 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TRNP1Q6NT89 227 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 RPAINQ86UA6 219 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 BANPQ8N9N5 519 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 SPOCK2Q92563 424 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 RTP4Q96DX8 246 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TBCBQ99426 244 aa24.09■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TSPAN1O60635 241 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 VTNP04004 478 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TAPT1Q6NXT6 567 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 NPNTQ6UXI9 565 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF398Q8TD17 642 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 NLRP7Q8WX94 980 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 MYLK2Q9H1R3 596 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa24.08■■□□□ 1.45
RABGGTA-202ENST00000399409 PFKMP08237 780 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 GRM5P41594 1212 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 ELK3P41970 407 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 FYB2Q5VWT5 728 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 OPTNQ96CV9 577 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 LRRC37BQ96QE4 947 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 VPS11Q9H270 941 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 CHMP2BQ9UQN3 213 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 DERAQ9Y315 318 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 TEX264Q9Y6I9 313 aa24.08■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC14Q49A88 953 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 CDCA5Q96FF9 252 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 KIF12Q96FN5 646 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 PNPLA8Q9NP80 782 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 IKBKGQ9Y6K9 419 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 APOL1O14791 398 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 MT-ND3P03897 115 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 C10orf82Q8WW14 230 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 FAF2Q96CS3 445 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 YY1AP1Q9H869 796 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 USP29Q9HBJ7 922 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 CYLDQ9NQC7 956 aa24.07■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF487B1APH4 448 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 KRT16P08779 473 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 C4orf22Q6V702 233 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF410Q86VK4 478 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 PLD5Q8N7P1 536 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC44A1Q8WWI5 657 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC4A5Q9BY07 1137 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 CHKBQ9Y259 395 aa24.06■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC6A3Q01959 620 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF792Q3KQV3 632 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 PKDCCQ504Y2 493 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 C1orf228Q6PIY5 440 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 OLFML1Q6UWY5 402 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 MOB2Q70IA6 237 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 OTOAQ7RTW8 1153 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 KIF2BQ8N4N8 673 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 TCP10LQ8TDR4 215 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 ADRA1DP25100 572 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 SDC4P31431 198 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 SESTD1Q86VW0 696 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 IGDCC3Q8IVU1 814 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 ERP27Q96DN0 273 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 ADAM33Q9BZ11 813 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.05■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 INHBAP08476 426 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 BCAR1P56945 870 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 CCNA1P78396 465 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 CDO1Q16878 200 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 PARP6Q2NL67 630 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC9A4Q6AI14 798 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM110Q86TL2 294 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 STK32AQ8WU08 396 aa24.04■■□□□ 1.44
RABGGTA-202ENST00000399409 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms