RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369306.7

PEX11B-201, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 11 beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PEX11B, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11B-201ENST00000369306 LHX8Q68G74 356 aa16.07■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 ACTL9Q8TC94 416 aa16.07■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CLEC4CQ8WTT0 213 aa16.07■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.07■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 RIPK2O43353 540 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 APOC2P02655 101 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 LMAN1P49257 510 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 VPS41P49754 854 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CDH6P55285 790 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 HDAC4P56524 1084 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 DYNLT1P63172 113 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 KCTD16Q68DU8 428 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 PIGZQ86VD9 579 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 VSIG1Q86XK7 387 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 RFX6Q8HWS3 928 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 HAUS1Q96CS2 278 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CALN1Q9BXU9 219 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.06■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 MDM4O15151 490 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 INPPL1O15357 1258 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 INHAP05111 366 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CKBP12277 381 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 PAX3P23760 479 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 DPYSL3Q14195 570 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 SLC29A2Q14542 456 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CCDC142Q17RM4 750 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 IZUMO3Q5VZ72 239 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 ECHDC2Q86YB7 292 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 MAP7D3Q8IWC1 876 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 RNF169Q8NCN4 708 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 SPATA18Q8TC71 538 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 SYT15Q9BQS2 421 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 PCDH9Q9HC56 1237 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CLDN5O00501 218 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 IL4RP24394 825 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CHKAP35790 457 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 APLP1P51693 650 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 SKOR1P84550 965 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 ADCY1Q08828 1119 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 IFFO1Q0D2I5 559 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 GRIK3Q13003 919 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 TFDP2Q14188 446 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 P3H1Q32P28 736 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 AGBL2Q5U5Z8 902 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 SCYL2Q6P3W7 929 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CLEC20AQ6ZU45 233 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CCDC25Q86WR0 208 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 RELL1Q8IUW5 271 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 SLAIN1Q8ND83 568 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 TMEM121Q9BTD3 319 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 TRPV6Q9H1D0 765 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CDH9Q9ULB4 789 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CEP350Q5VT06 3117 aa16.05■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 A0A1W2PQY0 241 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 ZNF487B1APH4 448 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 BEST1O76090 585 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 POMCP01189 267 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 SHBGP04278 402 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 CYP11A1P05108 521 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 FAM200BP0CF97 657 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 MMRN1Q13201 1228 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 TUSC3Q13454 348 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 KRT71Q3SY84 523 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 UROC1Q96N76 676 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 RNF157Q96PX1 679 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 RGS18Q9NS28 235 aa16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
PEX11B-201ENST00000369306 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms