RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 DAG1Q14118 895 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPY5RQ15761 445 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PROSER3Q2NL68 480 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 MZT2AQ6P582 158 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TERB1Q8NA31 727 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHKBQ93100 1093 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 IQCDQ96DY2 449 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC136Q96JN2 1154 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CIPCQ9C0C6 399 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM83DQ9H4H8 585 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMFRQ9UKV5 643 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM50BQ9Y247 325 aa3.75□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CGB1A6NKQ9 187 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 H7C1Q1 480 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 M0R3H8 397 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CES2O00748 559 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 KPNA5O15131 536 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMPCBO75439 489 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIRAPP58753 221 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBA4AP68366 448 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXF2Q12947 444 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNAB1Q14722 419 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 DENND2CQ68D51 928 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLAG1Q6DJT9 500 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF44Q7L0R7 432 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDB2Q92466 427 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX18Q96RF0 628 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMS19Q96T76 1030 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SARGQ9BW04 601 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX15Q9NRS6 342 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 FLRT1Q9NZU1 646 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 DKK4Q9UBT3 224 aa3.74□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 POM121BA6NF01 834 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TISP43B9A030 160 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE2Q2LH0YL09 131 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXOC5O00471 708 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 THAP12O43422 761 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGAP02671 866 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPHB2P29323 1055 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIK3CBP42338 1070 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 GATMP50440 423 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 RENBPP51606 427 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 COBLL1Q53SF7 1204 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIX1LQ8IVB5 337 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM36Q9NQ86 728 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D23Q9NUY8 699 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 HPSEQ9Y251 543 aa3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGPSO00116 658 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPRY2O43597 315 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMPRSS11DO60235 418 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX2O60749 519 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 USP1O94782 785 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 A1BGP04217 495 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK4P11802 303 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM27P14373 513 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD19P15391 556 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CREB1P16220 341 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSHRP16473 764 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 CERS1P27544 350 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBL1P28749 1068 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 NTSR1P30989 418 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCG1P45844 678 aa3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms