RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ATP2A3Q93084 1043 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 TWNKQ96RR1 684 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 NT5C1AQ9BXI3 368 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 DNAI2Q9GZS0 605 aa8.12□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.12□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.12□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.11□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP8.1□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.1□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.1□□□□□ -1.11
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SGMS1-201ENST00000361543 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 CEP63Q96MT8 703 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 ARID3AQ99856 593 aa8.1□□□□□ -1.11
SGMS1-201ENST00000361543 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.1□□□□□ -1.11
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