RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 GJD2Q9UKL4 321 aa20.26■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ATICP31939 592 aa20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 TTC13Q8NBP0 860 aa20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 CNPY3Q9BT09 278 aa20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ADORA2BP29275 332 aa20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 GABRB2P47870 512 aa20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ROR1Q01973 937 aa20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 PAFAH2Q99487 392 aa20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ITGA11Q9UKX5 1188 aa20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 SLC12A4Q9UP95 1085 aa20.25■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 GABBR2O75899 941 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ASMTLO95671 621 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 FGFR1P11362 822 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ELK3P41970 407 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 KCNJ2P63252 427 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC142Q17RM4 750 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 LCLAT1Q6UWP7 414 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 CATSPER4Q7RTX7 472 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 KCNN4O15554 427 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 CCL15Q16663 113 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ZNF618Q5T7W0 954 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 RSAD1Q9HA92 442 aa20.24■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 GHRP10912 638 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC130P13994 396 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 INCA1Q0VD86 236 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 TAZQ16635 292 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 PDIK1LQ8N165 341 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 KATNBL1Q9H079 304 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 MMP3P08254 477 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 RBL1P28749 1068 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 CCNA1P78396 465 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 LVRNQ6Q4G3 990 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 CEP128Q6ZU80 1094 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 PCGF5Q86SE9 256 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 FAF2Q96CS3 445 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 SGSM3Q96HU1 749 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ECT2Q9H8V3 914 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 VRTNQ9H8Y1 702 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 VTA1Q9NP79 307 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 C2CD2Q9Y426 696 aa20.23■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 LCP1P13796 627 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM155BO75949 473 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 IL4RP24394 825 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ADRA1DP25100 572 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 LMO2P25791 158 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 XRCC4Q13426 336 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 CFAP36Q96G28 342 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 RNF157Q96PX1 679 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.22■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 KBTBD13C9JR72 458 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 POU5F1BQ06416 359 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 SPARCL1Q14515 664 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 NOMO1Q15155 1222 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 MTFR1Q15390 333 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 HHATQ5VTY9 493 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 GPR142Q7Z601 462 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 FAM228AQ86W67 206 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 PLD5Q8N7P1 536 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.21■□□□□ 0.83
TM7SF3-201ENST00000343028 A8MXQ7 604 aa20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms