RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 HSPH1Q92598 858 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 SMOQ99835 787 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.08■□□□□ 0.81
UPP1-201ENST00000331803 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa20.08■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 PTPN9P43378 593 aa20.08■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 ADCY1Q08828 1119 aa20.08■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TCTN1Q2MV58 587 aa20.08■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 KCNK16Q96T55 309 aa20.08■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 NCAPGQ9BPX3 1015 aa20.08■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.08■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 DNAJB4Q9UDY4 337 aa20.08■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.08■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.08■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 SNX24Q9Y343 169 aa20.08■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 CD48P09326 243 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 NDUFV1P49821 464 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 CCL23P55773 120 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R7Q15435 360 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TAZQ16635 292 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 SCYL2Q6P3W7 929 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 OR10T2Q8NGX3 314 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 MYLPFQ96A32 169 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TOX2Q96NM4 488 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TSC2P49815 1807 aa20.07■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TET1Q8NFU7 2136 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 HSF2BPO75031 334 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TKTL1P51854 596 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 CACNA2D1P54289 1103 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TLE2Q04725 743 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TRIM60Q495X7 471 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 BOLA3Q53S33 107 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 PKMYT1Q99640 499 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 UBXN6Q9BZV1 441 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 LRFN2Q9ULH4 789 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 RABGGTBP53611 331 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 HDAC4P56524 1084 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 KRT17Q04695 432 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 CCDC114Q96M63 670 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 CASD1Q96PB1 797 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TMEM209Q96SK2 561 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.06■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 CXCL10P02778 98 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 MATKP42679 507 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TSPY1Q01534 308 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 RAB41Q5JT25 222 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 ZNF333Q96JL9 665 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 CALN1Q9BXU9 219 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.05■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TRAPPC3O43617 180 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 LIASO43766 372 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TADA2AO75478 443 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 ENDOD1O94919 500 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 FBXO21O94952 628 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 GAS8O95995 478 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 BDNFP23560 247 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 GBP1P32455 592 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 CDH6P55285 790 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 GPS2Q13227 327 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 DEFB106AQ8N104 65 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 MREGQ8N565 214 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TEKT4Q8WW24 435 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB9Q96C00 473 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 TBCBQ99426 244 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 GRHL1Q9NZI5 618 aa20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
UPP1-201ENST00000331803 HHLA1C9JL84 531 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms