RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 DPYSL4O14531 572 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 LILRB3O75022 631 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 GRAP2O75791 330 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 ABLIM3O94929 683 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 DNAJB2P25686 324 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 CTNNA2P26232 953 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 FLT3P36888 993 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 SLC5A3P53794 718 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 RAB33AQ14088 237 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 IRGQQ8WZA9 623 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 CNPY3Q9BT09 278 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC66A2RUB6 948 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 RB1P06400 928 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 PDGFRAP16234 1089 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 UBE3AQ05086 875 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 MGAT5BQ3V5L5 792 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 TRNP1Q6NT89 227 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 RXFP2Q8WXD0 754 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 SPATA17Q96L03 361 aa20.65■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 DAB1O75553 588 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 USP17L7P0C7H9 530 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 MYOGP15173 224 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 DESP17661 470 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 DNA2P51530 1060 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 DUSP4Q13115 394 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 DDR2Q16832 855 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 SAMD11Q96NU1 681 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 MAFFQ9ULX9 164 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC71-201ENST00000321895 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 CES2O00748 559 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 CA3P07451 260 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 ATF2P15336 505 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 SDC4P31431 198 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 TUFMP49411 452 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 TMC7Q7Z402 723 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 NUP93Q8N1F7 819 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 PSMB7Q99436 277 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 USTQ9Y2C2 406 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 IRAK3Q9Y616 596 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 PLXNA3P51805 1871 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 KCNK3O14649 394 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 PSTPIP1O43586 416 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 SRGAP2O75044 1071 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGEF15O94989 841 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 MATKP42679 507 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 PTPN9P43378 593 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 GPR15P49685 360 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 SCAMP5Q8TAC9 235 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 PBKQ96KB5 322 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 SLC2A13Q96QE2 648 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 FBXO44Q9H4M3 255 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 E7ENQ6 273 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 TEX28O15482 410 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 RNF8O76064 485 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 LTFP02788 710 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 CXCR5P32302 372 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 PEX5P50542 639 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC14Q49A88 953 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 LRRC38Q5VT99 294 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 COG1Q8WTW3 980 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 ALG3Q92685 438 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 KRT35Q92764 455 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 GOLGA1Q92805 767 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 NCAPGQ9BPX3 1015 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 CARD9Q9H257 536 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71-201ENST00000321895 COMMD8Q9NX08 183 aa20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms