RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 DAOAP59103 153 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ACAP1Q15027 740 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 MGAT5BQ3V5L5 792 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SCML4Q8N228 414 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 COG1Q8WTW3 980 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 RXFP2Q8WXD0 754 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 GBF1Q92538 1859 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CNPY3Q9BT09 278 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 PLVAPQ9BX97 442 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 VNN2O95498 520 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CTSAP10619 480 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SDC4P31431 198 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 DDR2Q16832 855 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 TRNP1Q6NT89 227 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC9BQ8N6N2 239 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 AUTS2Q8WXX7 1259 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT35Q92764 455 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 USP3Q9Y6I4 520 aa21.73■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CES2O00748 559 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 DPYSL4O14531 572 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFRSF10BO14763 440 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 PSTPIP1O43586 416 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SSR1P43307 286 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 DUSP4Q13115 394 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 TPGS2Q68CL5 300 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 RHOT1Q8IXI2 618 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 IRGQQ8WZA9 623 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CAPZA3Q96KX2 299 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 LZTS1Q9Y250 596 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.72■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF185O15231 689 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 DAB1O75553 588 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF8O76064 485 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 MARCKSL1P49006 195 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR15P49685 360 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP93Q8N1F7 819 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ALG3Q92685 438 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA1Q92805 767 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 PBKQ96KB5 322 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CFAP57Q96MR6 1250 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
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PACSIN3-201ENST00000298838 CRISPLD1Q9H336 500 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 FNIP2Q9P278 1114 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 LRCH4O75427 683 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 ABLIM3O94929 683 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 MYOGP15173 224 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CA8P35219 290 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 PEX5P50542 639 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB33AQ14088 237 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC14Q49A88 953 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
PACSIN3-201ENST00000298838 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 E7ENQ6 273 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 LILRB3O75022 631 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 CA3P07451 260 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 ATF2P15336 505 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 MATKP42679 507 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPN9P43378 593 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 TUFMP49411 452 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 RWDD2BP57060 319 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC181Q5TID7 509 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 CREG2Q8IUH2 290 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA17Q96L03 361 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 SOAT2O75908 522 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 LTFP02788 710 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 TAS2R40P59535 323 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP11AP98196 1134 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 HADHQ16836 314 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC38Q5VT99 294 aa21.69■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 TMC7Q7Z402 723 aa21.69■■□□□ 1.06
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