RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ACADMP11310 421 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 FDPSP14324 419 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPHP41219 470 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GRK6P43250 576 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A11P48066 632 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 FOSBP53539 338 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CFHR1Q03591 330 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 ANO4Q32M45 955 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GRAMD4Q6IC98 578 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 DPH6Q7L8W6 267 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR155Q7Z3F1 870 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MYCT1Q8N699 235 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC52Q8N7C0 313 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 DNASE2BQ8WZ79 361 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 SKA1Q96BD8 255 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 PARVGQ9HBI0 331 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 MYH11P35749 1972 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.4□□□□□ -1.06
PGGT1B-201ENST00000296642 OBSL1O75147 1896 aa8.4□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TSC2P49815 1807 aa8.4□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC26A4O43511 780 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAK2O60296 914 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CILPO75339 1184 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TULP3O75386 442 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT19P08727 400 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G4BP0C869 781 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 NCAM1P13591 858 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 JUPP14923 745 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOT2P49753 483 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CDR1P51861 262 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ANAPC15P60006 121 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 EMC10Q5UCC4 262 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC15Q8TF66 581 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 UCMAQ8WVF2 138 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 POMGNT1Q8WZA1 660 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CALML4Q96GE6 196 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ZHX3Q9H4I2 956 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CLMPQ9H6B4 373 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TMLHEQ9NVH6 421 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR35Q9P2L0 1181 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH9Q9ULB4 789 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 AGAP1Q9UPQ3 857 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX9Q9Y5X1 595 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 AK5Q9Y6K8 562 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRDP23468 1912 aa8.39□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF840PA6NDX5 716 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM189A1O60320 539 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 OLFM2O95897 454 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PRB1P04280 392 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGB3P05106 788 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 C1SP09871 688 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFV2P19404 249 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CCT8P50990 548 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 UCNP55089 124 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 NOP14P78316 857 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 RBP5P82980 135 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 GUCY1B3Q02153 619 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP27A1Q02318 531 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNC4Q03721 635 aa8.38□□□□□ -1.07
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