RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 ROBO3Q96MS0 1386 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 KDM1AO60341 852 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TGDSO95455 350 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 SERPINB5P36952 375 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 NXNQ6DKJ4 435 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 POTEHQ6S545 545 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 PACS1Q6VY07 963 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 TRPV6Q9H1D0 765 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 C1orf112Q9NSG2 853 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 DNAJB4Q9UDY4 337 aa11.83□□□□□ -0.51
PTPRR-201ENST00000283228 MCF2LO15068 1137 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SLC16A4O15374 487 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GSTT2P0CG29 244 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GSTT2BP0CG30 244 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ALDH1B1P30837 517 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 EMP3P54852 163 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 C21orf59P57076 290 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 BMT2Q1RMZ1 405 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF410Q86VK4 478 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RTKN2Q8IZC4 609 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGEF37A1IGU5 675 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GOLGA8OA6NCC3 632 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GOLGA8NF8WBI6 632 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 J3QRK9 145 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CBFA2T3O75081 653 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MAP3K6O95382 1288 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 NTSR2O95665 410 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MYBPC1Q00872 1141 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RELAQ04206 551 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 BSPRYQ5W0U4 402 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CASC4Q6P4E1 433 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 XKR5Q6UX68 686 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 C16orf86Q6ZW13 317 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ALLCQ8N6M5 410 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 POMGNT1Q8WZA1 660 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 FBXL8Q96CD0 374 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 COX4I2Q96KJ9 171 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 DRC3Q9H069 523 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GLI3P10071 1580 aa11.83□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CAPN14A8MX76 684 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 KLHL2O95198 593 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SERPINA6P08185 405 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PCYT1AP49585 367 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TSPY1Q01534 308 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF394Q53GI3 561 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 RFX6Q8HWS3 928 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 LMO3Q8TAP4 145 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 ACTL9Q8TC94 416 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 BTBD9Q96Q07 612 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 KCNK16Q96T55 309 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 NYXQ9GZU5 481 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PCSK1NQ9UHG2 260 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CST8O60676 142 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MTA2O94776 668 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SLITRK3O94933 977 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PEX3P56589 373 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PSMC5P62195 406 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GRM2Q14416 872 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CALN1Q9BXU9 219 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 OSBPL6Q9BZF3 934 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TNNI1P19237 187 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GDF10P55107 478 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 WDR44Q5JSH3 913 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 KRT39Q6A163 491 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM270Q6UE05 265 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 GPR141Q7Z602 305 aa11.82□□□□□ -0.52
PTPRR-201ENST00000283228 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms