RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 MGEA5O60502 916 aa16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 GRAP2O75791 330 aa16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 ADCY8P40145 1251 aa16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 ZNF844Q08AG5 666 aa16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 UPP1Q16831 310 aa16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 AGBL2Q5U5Z8 902 aa16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 BBS12Q6ZW61 710 aa16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 TBCBQ99426 244 aa16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 DNPEPQ9ULA0 475 aa16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 HTTP42858 3142 aa16.02■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 NDC80O14777 642 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 ITGAVP06756 1048 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 RARGP13631 454 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 IVDP26440 423 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 PTPN9P43378 593 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 TRNP1Q6NT89 227 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 SPATA18Q8TC71 538 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 HSPH1Q92598 858 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 CFAP57Q96MR6 1250 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 B3GNT5Q9BYG0 378 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 CST8O60676 142 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 ENDOD1O94919 500 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 FAM107AO95990 144 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 INHAP05111 366 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 CKBP12277 381 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 VCPP55072 806 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 PLCB3Q01970 1234 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 GRIK3Q13003 919 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 PDK2Q15119 407 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 CDO1Q16878 200 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 LHX8Q68G74 356 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 VSIG1Q86XK7 387 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 FUKQ8N0W3 1084 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 RNF169Q8NCN4 708 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 FAM172AQ8WUF8 416 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 TEKT4Q8WW24 435 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 UROC1Q96N76 676 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 RABEP2Q9H5N1 569 aa16.01■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 GABBR2O75899 941 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 LCP1P13796 627 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 NPR3P17342 541 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 ATP11AP98196 1134 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 TAF5Q15542 800 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 ALLCQ8N6M5 410 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 KCTD13Q8WZ19 329 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 FAM118BQ9BPY3 351 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 STARD7Q9NQZ5 370 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 ANAPC5Q9UJX4 755 aa16■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 FKTNO75072 461 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 KIAA0754O94854 1291 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 APOC2P02655 101 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 NUDT17P0C025 328 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 KLRC2P26717 231 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 CDH6P55285 790 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 TUSC3Q13454 348 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 TFDP2Q14188 446 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 SCYL2Q6P3W7 929 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 RHBDF2Q6PJF5 856 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 CEP128Q6ZU80 1094 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 PIGZQ86VD9 579 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 PACS2Q86VP3 889 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 NLRP14Q86W24 1093 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 CCT8L2Q96SF2 557 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 MED10Q9BTT4 135 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 CALN1Q9BXU9 219 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 CENPHQ9H3R5 247 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 RGS18Q9NS28 235 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 CDH9Q9ULB4 789 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 A0A1W2PQY0 241 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 ARHGEF37A1IGU5 675 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 CASTOR2A6NHX0 329 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 MDM4O15151 490 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 ATP2C2O75185 946 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 EOMESO95936 686 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 POMCP01189 267 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 ODC1P11926 461 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 PCSK1P29120 753 aa15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 TKTP29401 623 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SF3B4-201ENST00000271628 GRK4P32298 578 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms