RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 PAX7P23759 505 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 LMO2P25791 158 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 SERPINB3P29508 390 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 PTK7Q13308 1070 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 PEX6Q13608 980 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 KRT81Q14533 505 aa9.05□□□□□ -0.96
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GINS1-201ENST00000262460 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 TRIM72Q6ZMU5 477 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 NLRP9Q7RTR0 991 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 KIF12Q96FN5 646 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 PPP1R36Q96LQ0 422 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 NCAPGQ9BPX3 1015 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 HEY2Q9UBP5 337 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 LGALS13Q9UHV8 139 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
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GINS1-201ENST00000262460 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 ATP5DP30049 168 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 MAN1A1P33908 653 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 GPD2P43304 727 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 MCL1Q07820 350 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 RCN2Q14257 317 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
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GINS1-201ENST00000262460 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 DSTYKQ6XUX3 929 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A41Q8N5S1 370 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 PNPLA1Q8N8W4 532 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 ARMC2Q8NEN0 867 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 USP6NLQ92738 828 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 TMEM176AQ96HP8 235 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 MIPEPQ99797 713 aa9.05□□□□□ -0.96
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GINS1-201ENST00000262460 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 SNTG2Q9NY99 539 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 CSADQ9Y600 493 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa9.05□□□□□ -0.96
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GINS1-201ENST00000262460 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
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GINS1-201ENST00000262460 MORF4L2Q15014 288 aa9.05□□□□□ -0.96
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GINS1-201ENST00000262460 CASC4Q6P4E1 433 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 ILDR2Q71H61 639 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 FAM172AQ8WUF8 416 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 P3H4Q92791 437 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.05□□□□□ -0.96
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GINS1-201ENST00000262460 ELF1P32519 619 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 CAV1Q03135 178 aa9.04□□□□□ -0.96
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GINS1-201ENST00000262460 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 TTC30AQ86WT1 665 aa9.04□□□□□ -0.96
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GINS1-201ENST00000262460 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS1-201ENST00000262460 C10orf82Q8WW14 230 aa9.04□□□□□ -0.96
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