RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
CPS1-201ENST00000233072 KIF1AQ12756 1690 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 RASSF9O75901 435 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 RBP3P10745 1247 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 LSP1P33241 339 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ZNF284Q2VY69 593 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 GRTP1Q5TC63 336 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 CYP4A22Q5TCH4 519 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ZNF280DQ6N043 979 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ARRDC4Q8NCT1 418 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 UBA3Q8TBC4 463 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ASB2Q96Q27 587 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 TAAR1Q96RJ0 339 aa7.46□□□□□ -1.22
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CPS1-201ENST00000233072 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 M0QYT0 321 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
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CPS1-201ENST00000233072 CYTH1Q15438 398 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 SPANXN3Q5MJ09 141 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 CHP1Q99653 195 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 PXMP2Q9NR77 195 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 TECPR2O15040 1411 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 AP1G2O75843 785 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 PTPAQ15257 358 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 E2F4Q16254 413 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ZNF410Q86VK4 478 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 KRT78Q8N1N4 520 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 GLT1D1Q96MS3 346 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ZIM3Q96PE6 472 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 TSPAN18Q96SJ8 248 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ECSITQ9BQ95 431 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.46□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 F8W810 466 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 URODP06132 367 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 NUP107P57740 925 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 PDIA6Q15084 440 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 AGR3Q8TD06 166 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 FBXO32Q969P5 355 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 OTULINQ96BN8 352 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 CNDP1Q96KN2 507 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 B2RBV5 119 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 AIM2O14862 343 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 CALB2P22676 271 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 NR2C2P49116 596 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ACAP1Q15027 740 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 CCNG2Q16589 344 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ERO1BQ86YB8 467 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 PGBD3Q8N328 593 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 CAVIN3Q969G5 261 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 VCPIP1Q96JH7 1222 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 SPATA17Q96L03 361 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 UROC1Q96N76 676 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 CCT7Q99832 543 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 AHSPQ9NZD4 102 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ADCY3O60266 1144 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 PROSCO94903 275 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 ASS1P00966 412 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 VCAM1P19320 739 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 PTPN3P26045 913 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 HSD17B3P37058 310 aa7.45□□□□□ -1.22
CPS1-201ENST00000233072 NPY2RP49146 381 aa7.45□□□□□ -1.22
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