RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	YJR146W	P47174	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	PMP3	P87284	55 aa		4.16	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	HPA2	Q06592	156 aa		4.16	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YLR194C	Q05777	254 aa		4.16	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.16	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.74	not detected
AMD1	YML035C	HAL1	Q01766	294 aa		4.15	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	IGO2	Q9P305	131 aa		4.15	□□□□□ -1.74
AMD1	YML035C	CRC1	Q12289	327 aa		4.15	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	UGX2	P32772	223 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	TRP1	P00912	224 aa		4.14	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	DSE2	P38844	325 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	YEL008W	P40001	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
AMD1	YML035C	MRPS12	P53732	153 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	SPC1	P46965	94 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	YGR039W	P53225	103 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	ABF2	Q02486	183 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	SHU1	P38751	150 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		4.1	□□□□□ -1.75
AMD1	YML035C	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.09	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	YAR029W	P39549	74 aa		4.09	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.09	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	ERG28	P40030	148 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	YIA6	P40556	373 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	CWP2	P43497	92 aa		4.08	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	YMR295C	Q03559	197 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	KRE1	P17260	313 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	YBR219C	P38317	127 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	PEX17	P40155	199 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	RPR2	P40571	144 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.07	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	YMR320W	Q04897	101 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	RTC6	O14464	93 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	KNH1	P50112	268 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	ENV10	Q99382	181 aa		4.04	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	PBA1	Q05778	276 aa		4.03	□□□□□ -1.76
AMD1	YML035C	YHR139C-A	O13536	103 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YLR415C	O13578	112 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YDR115W	Q04598	105 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YCR085W	P25650	117 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	RPC10	P40422	70 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	AIM19	P40502	157 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	HUR1	P45820	110 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	DIF1	O13577	133 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	QCR8	P08525	94 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YDR029W	Q12111	104 aa		4	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	SVP26	P38869	228 aa		4	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	COX14	P39103	70 aa		4	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	PPT2	Q12036	173 aa		4	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		4	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YDL241W	Q07738	123 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	SMP1	P38128	452 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	RGM1	Q00453	211 aa		3.99	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YAL065C	O13511	128 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	RAD6	P06104	172 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YHL042W	P38729	150 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YAL064W	P39711	94 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	RRT15	Q3E811	62 aa		3.97	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	ECM12	O13529	151 aa		3.96	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.96	□□□□□ -1.77
AMD1	YML035C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	SAP30	P38429	201 aa		3.96	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	UBC11	P52492	156 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	STF1	P01098	86 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	MPC3	P53311	146 aa		3.95	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		3.94	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	IRC21	Q04772	201 aa		3.93	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	YPR195C	Q06594	109 aa		3.93	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	EMC6	Q12431	108 aa		3.92	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	TOM6	P33448	61 aa		3.91	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	AQY2	P0CD90	149 aa		3.9	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		3.9	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	MSA2	P36157	363 aa		3.9	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		3.9	□□□□□ -1.78
AMD1	YML035C	YCR050C	P25630	102 aa		3.9	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	MVB12	P42939	101 aa		3.9	□□□□□ -1.79

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