RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	DNM3	Q9UQ16	869 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958		I3L4J1	428 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	TGFB1I1	O43294	461 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	LPXN	O60711	386 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	KDSR	Q06136	332 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC5A5	Q92911	643 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	EME1	Q96AY2	570 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	SELENON	Q9NZV5	590 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	POTEB3	A0JP26	581 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	ADCY6	O43306	1168 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	KLHL2	O95198	593 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	POLR2M	P0CAP2	368 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	THRA	P10827	490 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	WASHC5	Q12768	1159 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	MYBPC2	Q14324	1141 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	POTEB	Q6S5H4	581 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	DLK2	Q6UY11	383 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	OGFOD1	Q8N543	542 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	LRGUK	Q96M69	825 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	HGH1	Q9BTY7	390 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	DMAC2	Q9NW81	257 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	PSTPIP1	O43586	416 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	ESRRB	O95718	433 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	OCM2	P0CE71	109 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	PTPN2	P17706	415 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	ENTPD1	P49961	510 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	NDUFA5	Q16718	116 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	APBB2	Q92870	758 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	RANBP9	Q96S59	729 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	PAFAH2	Q99487	392 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	REEP2	Q9BRK0	252 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CDH22	Q9UJ99	828 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	POMP	Q9Y244	141 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	RBP3	P10745	1247 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	ATP6V1B1	P15313	513 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	BGN	P21810	368 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	CCR3	P51677	355 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	RHBDL3	P58872	404 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	STARD8	Q92502	1023 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	NUF2	Q9BZD4	464 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	PMM2	O15305	246 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	MYL4	P12829	197 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	SERPINB6	P35237	376 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CPEB1-215	ENST00000617958	GPX6	P59796	221 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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