RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 BECN2A8MW95 431 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 HHLA1C9JL84 531 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 CALCAP01258 141 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 VDRP11473 427 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 NPR3P17342 541 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 FCARP24071 287 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC5A3P53794 718 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 MFAP3P55082 362 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 ARHGAP44Q17R89 818 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 TTC30AQ86WT1 665 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 SCAMP5Q8TAC9 235 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 TFAP2BQ92481 460 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM81BQ96LP2 452 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 ASB16Q96NS5 453 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 GCNAQ96QF7 691 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 ZSWIM1Q9BR11 485 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 DUSP16Q9BY84 665 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 GPR88Q9GZN0 384 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 CBX8Q9HC52 389 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 IL37Q9NZH6 218 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 DNAJC12Q9UKB3 198 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 TSPAN16Q9UKR8 245 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 SORCS3Q9UPU3 1222 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.98□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 TRIOO75962 3097 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM92AA1XBS5 289 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 LGALS16A8MUM7 142 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 O00370 1275 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 DCXO43602 365 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 TPM2P07951 284 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 KRT5P13647 590 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 CD19P15391 556 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 KLK7P49862 253 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 SGO2Q562F6 1265 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 GPR158Q5T848 1215 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 TANGO2Q6ICL3 276 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 MTSS1LQ765P7 747 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 LUZP1Q86V48 1076 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC44A3Q8N4M1 653 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 ANKRD52Q8NB46 1076 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 SHC3Q92529 594 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 SMARCD2Q92925 531 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 NXPE3Q969Y0 559 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC46A2Q9BY10 475 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 EPHX3Q9H6B9 360 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 TASP1Q9H6P5 420 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 ACP6Q9NPH0 428 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 EHD2Q9NZN4 543 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 KIAA1257Q9ULG3 409 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 NCANO14594 1321 aa11.97□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 CAVIN2O95810 425 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 ALADP13716 330 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 UCHL3P15374 230 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 YWHAQP27348 245 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 TAF10Q12962 218 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 TDGQ13569 410 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 PKDCCQ504Y2 493 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 TXNDC8Q6A555 127 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 KXD1Q9BQD3 176 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 TRPV4Q9HBA0 871 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 PLCB1Q9NQ66 1216 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.96□□□□□ -0.49
CCL3L3-201ENST00000612839 C2orf78A6NCI8 922 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF840PA6NDX5 716 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 SOBPA7XYQ1 873 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 TULP2O00295 520 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 NARSO43776 548 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 ECI2O75521 394 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 WEE1P30291 646 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 VIPR2P41587 438 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 PPP3CCP48454 512 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 BCAT1P54687 386 aa11.95□□□□□ -0.5
CCL3L3-201ENST00000612839 FOXK1P85037 733 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms