RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 THAP2Q9H0W7 228 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-235ENST00000601247 FBXO44Q9H4M3 255 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-235ENST00000601247 PARVAQ9NVD7 372 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-235ENST00000601247 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-235ENST00000601247 NENFQ9UMX5 172 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-235ENST00000601247 YIPF1Q9Y548 306 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-235ENST00000601247 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-235ENST00000601247 TULP2O00295 520 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 ERBB2P04626 1255 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 SPATA31D3P0C874 917 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 SRGAP2BP0DMP2 458 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CACNA2D1P54289 1103 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF697Q5TEC3 545 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 DCUN1D2Q6PH85 259 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM110Q86TL2 294 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 ITIH5Q86UX2 942 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 NUP93Q8N1F7 819 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 TTC9BQ8N6N2 239 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 PACSIN1Q9BY11 444 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 COMMD8Q9NX08 183 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CYTH4Q9UIA0 394 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 INSL5Q9Y5Q6 135 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CEP290O15078 2479 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 RFXAPO00287 272 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 SOAT2O75908 522 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 SEC24AO95486 1093 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 ZBED1O96006 694 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 C8AP07357 584 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CSH1P0DML2 217 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CSH2P0DML3 217 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 RRM1P23921 792 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 GABRB2P47870 512 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CLCN4P51793 760 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 SLC5A3P53794 718 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 TWF1Q12792 350 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CAMK1Q14012 370 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 C2CD6Q53TS8 623 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 RTL10Q7L3V2 364 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 ZSCAN30Q86W11 494 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 ZMIZ2Q8NF64 920 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 SLC7A14Q8TBB6 771 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 GIPC2Q8TF65 315 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 RFFLQ8WZ73 363 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 TRIM62Q9BVG3 475 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 EPOPA6NHQ4 379 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 PJA2O43164 708 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CYP1A2P05177 515 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 NRIP1P48552 1158 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 GPR15P49685 360 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 SLC6A3Q01959 620 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 LLGL2Q6P1M3 1020 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 LILRA6Q6PI73 481 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 XYLT1Q86Y38 959 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 SCUBE3Q8IX30 993 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 C3orf20Q8ND61 904 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 IRGQQ8WZA9 623 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 FBXO32Q969P5 355 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 FAM149B1Q96BN6 582 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 NUP85Q9BW27 656 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 MAN1C1Q9NR34 630 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 LCMT1Q9UIC8 334 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 GUCA1BQ9UMX6 200 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 ASB3Q9Y575 518 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 NCANO14594 1321 aa16.05■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 MACROD2A1Z1Q3 448 aa16.05■□□□□ 0.16
FCHO1-235ENST00000601247 HHLA1C9JL84 531 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms