RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 TNMDQ9H2S6 317 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1586Q9HCI6 787 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP97Q9P2B7 532 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 MTMR6Q9Y217 621 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 TACC1O75410 805 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 E2F4Q16254 413 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2U1Q7Z449 544 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 ALLCQ8N6M5 410 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1958Q8N8K9 716 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CGRRF1Q99675 332 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM9Q9C026 710 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 KBTBD4Q9NVX7 518 aa27.32■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPRDP23468 1912 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 TGFB1I1O43294 461 aa27.31■■□□□ 1.96
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CAPNS1-211ENST00000590874 TNNI1P19237 187 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 RHBDF2Q6PJF5 856 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 IL17RCQ8NAC3 791 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 OLIG1Q8TAK6 271 aa27.31■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 SGK1O00141 431 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN5O00501 218 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 TIE1P35590 1138 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 NASPP49321 788 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP24A1Q07973 514 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD6Q15008 389 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR72Q3MJ13 1102 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF507Q8TCN5 953 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 RLN3Q8WXF3 142 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC127Q96BQ5 260 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 PNKPQ96T60 521 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 ELOVL4Q9GZR5 314 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMA1P25391 3075 aa27.3■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 KAT7O95251 611 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP2J2P51589 502 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 TNNC1P63316 161 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 ASIC1P78348 528 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 IRX4P78413 519 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 EMC10Q5UCC4 262 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 SLITRK1Q96PX8 696 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 FNBP1Q96RU3 617 aa27.29■■□□□ 1.96
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM9BQ9NQ34 198 aa27.29■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CLIC2O15247 247 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 APODP05090 189 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM163BP0C2L3 166 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 KDSRQ06136 332 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM26FQ5R3K3 315 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 NELFCDQ8IXH7 590 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 FRMD1Q8N878 549 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00301Q8NCQ3 95 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF516Q92618 1163 aa27.28■■□□□ 1.96
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CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC27Q9C0I9 530 aa27.28■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MXQ7 604 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 ALDH1A2O94788 518 aa27.27■■□□□ 1.96
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CAPNS1-211ENST00000590874 ADH5P11766 374 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RY2P41231 377 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 MYL6P60660 151 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 STK38Q15208 465 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 DHX58Q96C10 678 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
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CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF4Q9NR80 690 aa27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0A0MRY4 1105 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 COCHO43405 550 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM23O75077 832 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 PROS1P07225 676 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QTNF9P0C862 333 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 YWHAQP27348 245 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXC1Q12948 553 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-211ENST00000590874 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
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