RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 C12orf40Q86WS4 652 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 IQUBQ8NA54 791 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 OR6B3Q8NGW1 331 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 USP33Q8TEY7 942 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 ACDQ96AP0 544 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 C8orf48Q96LL4 319 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 FNBP1Q96RU3 617 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 C7orf25Q9BPX7 421 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 B3GNT5Q9BYG0 378 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 TPSD1Q9BZJ3 242 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 SNX25Q9H3E2 840 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 SMYD3Q9H7B4 428 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 EBF1Q9UH73 591 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-208ENST00000590422 INVSQ9Y283 1065 aa12.9□□□□□ -0.34
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CTIF-208ENST00000590422 MYH10P35580 1976 aa12.89□□□□□ -0.35
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CTIF-208ENST00000590422 CUTAO60888 179 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 TNNC1P63316 161 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 SLC7A9P82251 487 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 BMT2Q1RMZ1 405 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 C2orf27AQ580R0 203 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 STPG1Q5TH74 334 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 IL31Q6EBC2 164 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 UNC13DQ70J99 1090 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 XXYLT1Q8NBI6 393 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 CEP295NLQ96MC4 621 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 LRRC27Q9C0I9 530 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 SLC39A2Q9NP94 309 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 CFAP97Q9P2B7 532 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 GON4LQ3T8J9 2241 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 ZFHX4Q86UP3 3567 aa12.88□□□□□ -0.35
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CTIF-208ENST00000590422 STAU1O95793 577 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 ABL1P00519 1130 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 PFKLP17858 780 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 BCKDHBP21953 392 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 SLC6A11P48066 632 aa12.88□□□□□ -0.35
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CTIF-208ENST00000590422 DGKEP52429 567 aa12.88□□□□□ -0.35
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CTIF-208ENST00000590422 TSTD1Q8NFU3 115 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 EXOC4Q96A65 974 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 KCNK16Q96T55 309 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 ELOVL4Q9GZR5 314 aa12.88□□□□□ -0.35
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CTIF-208ENST00000590422 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 A8MXQ7 604 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 COCHO43405 550 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 GBP1P32455 592 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 AFMP43652 599 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 CDH8P55286 799 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 PKP1Q13835 747 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 ELF2Q15723 593 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 TMEM92Q6UXU6 159 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa12.87□□□□□ -0.35
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CTIF-208ENST00000590422 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 SCAMP5Q8TAC9 235 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 MAGEF1Q9HAY2 307 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 VPS45Q9NRW7 570 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 MMP17Q9ULZ9 603 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 PCDHA7Q9UN72 937 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 LNP1A1A4G5 178 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 KLRC4O43908 158 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 EXOC3O60645 756 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 VNN1O95497 513 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CTIF-208ENST00000590422 YWHAQP27348 245 aa12.86□□□□□ -0.35
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