RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 OR1D2P34982 312 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PRKCIP41743 596 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GLUD2P49448 558 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE6CP51160 858 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CDR2Q01850 454 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE4CQ08493 712 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GPM6BQ13491 265 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CAMK1Q14012 370 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MEA1Q16626 185 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPROQ16827 1216 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SGO2Q562F6 1265 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP4A22Q5TCH4 519 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM35AQ86V20 835 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 FUKQ8N0W3 1084 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SPPL3Q8TCT6 385 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PCED1BQ96HM7 432 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM161BQ96MY7 647 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNK16Q96T55 309 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PKMYT1Q99640 499 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SMOQ99835 787 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TCF25Q9BQ70 676 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TTPALQ9BTX7 342 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBP1Q9H171 429 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT82Q9NSB4 513 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO6Q9UM54 1294 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NENFQ9UMX5 172 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.39□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR27A2RRH5 827 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MTMR11A4FU01 709 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SYN3O14994 580 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PER2O15055 1255 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAPPC3O43617 180 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TBC1D4O60343 1298 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 OAZ2O95190 189 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFA10O95299 355 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ERBB2P04626 1255 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 URODP06132 367 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PAEPP09466 180 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 VDRP11473 427 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 BMP8BP34820 402 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 LHX1P48742 406 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP3K7CLP57077 242 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVK-21P61565 698 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NOMO3P69849 1222 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ROR1Q01973 937 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DSG1Q02413 1049 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MTMR3Q13615 1198 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PTPN14Q15678 1187 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 USP41Q3LFD5 358 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF280DQ6N043 979 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TMC7Q7Z402 723 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 UNC93AQ86WB7 457 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 THEM5Q8N1Q8 247 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GIPC2Q8TF65 315 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.38□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.38□□□□□ -1.39
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