RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 C12orf40Q86WS4 652 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 NT5DC4Q86YG4 428 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 CFAP97Q9P2B7 532 aa23.3■■□□□ 1.32
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CAPNS1-205ENST00000588780 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
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CAPNS1-205ENST00000588780 PLCG1P19174 1290 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 WASP42768 502 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 LHX1P48742 406 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 MCTP1Q6DN14 999 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 OSTM1Q86WC4 334 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 NAXDQ8IW45 347 aa23.29■■□□□ 1.32
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIML1Q8N9V2 468 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 ERLEC1Q96DZ1 483 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 CALML4Q96GE6 196 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 HSPA12BQ96MM6 686 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 IGSF10Q6WRI0 2623 aa23.28■■□□□ 1.32
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CAPNS1-205ENST00000588780 CYP27A1Q02318 531 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC14A1Q13336 389 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 RHBDF2Q6PJF5 856 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 NUDT18Q6ZVK8 323 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 NAT16Q8N8M0 369 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 PKMYT1Q99640 499 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM213AQ9BRX8 229 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 EHD2Q9NZN4 543 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 CYP8B1Q9UNU6 501 aa23.28■■□□□ 1.32
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CAPNS1-205ENST00000588780 BDNFP23560 247 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF131P52739 623 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC7A9P82251 487 aa23.27■■□□□ 1.32
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CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PQD8 194 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP2C2O75185 946 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 GNSP15586 552 aa23.26■■□□□ 1.31
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CAPNS1-205ENST00000588780 USP46P62068 366 aa23.26■■□□□ 1.31
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CAPNS1-205ENST00000588780 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 LY6G5CQ5SRR4 150 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 C10orf76Q5T2E6 689 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 SYCP2LQ5T4T6 812 aa23.26■■□□□ 1.31
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CAPNS1-205ENST00000588780 C1orf127Q8N9H9 656 aa23.26■■□□□ 1.31
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CAPNS1-205ENST00000588780 MYLPFQ96A32 169 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 SPATA17Q96L03 361 aa23.26■■□□□ 1.31
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CAPNS1-205ENST00000588780 SYT15Q9BQS2 421 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 TBC1D14Q9P2M4 693 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 SUSD2Q9UGT4 822 aa23.26■■□□□ 1.31
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CAPNS1-205ENST00000588780 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa23.25■■□□□ 1.31
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CAPNS1-205ENST00000588780 SDE2Q6IQ49 451 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 VSTM1Q6UX27 236 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 TOP6BLQ8N6T0 577 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC52Q8N7C0 313 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 IKZF4Q9H2S9 585 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 DEC1Q9P2X7 70 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 STYXL1Q9Y6J8 313 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 FREM2Q5SZK8 3169 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 APC2O95996 2303 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 MYOFQ9NZM1 2061 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A0A0MRY4 1105 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP3CCP48454 512 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 RBP5P82980 135 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-205ENST00000588780 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
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