RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 SIX2Q9NPC8 291 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 RGL1Q9NZL6 768 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SAMM50Q9Y512 469 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 C17orf102A2RUQ5 167 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NCAM2O15394 837 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CHMP2AO43633 222 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 BUB1O43683 1085 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ABL1P00519 1130 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GH1P01241 217 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ALAS1P13196 640 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SLC9A1P19634 815 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 RDXP35241 583 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GGCXP38435 758 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CETN2P41208 172 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CXCL12P48061 93 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FNTAP49354 379 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PDE6CP51160 858 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GPC3P51654 580 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PTENP60484 403 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CAV1Q03135 178 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ARID5AQ03989 594 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PPP2R5DQ14738 602 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SLMAPQ14BN4 828 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NSMFQ6X4W1 530 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DNERQ8NFT8 737 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GLG1Q92896 1179 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CEP89Q96ST8 783 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 AGPAT1Q99943 283 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SYT11Q9BT88 431 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 RNPEPQ9H4A4 650 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GTF3C4Q9UKN8 822 aa8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 HIVEP1P15822 2718 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 EBAG9O00559 213 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ZNF185O15231 689 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 THAP12O43422 761 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CEP104O60308 925 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ITGB5P18084 799 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CR2P20023 1033 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ATP5DP30049 168 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CD52P31358 61 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 RFC5P40937 340 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CYP2J2P51589 502 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SNAP25P60880 206 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ADAM17P78536 824 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GUCY2DQ02846 1103 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CYP4F3Q08477 520 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 MAPK7Q13164 816 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SLC30A10Q6XR72 485 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 HAUS6Q7Z4H7 955 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 WDR5BQ86VZ2 330 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 IQCKQ8N0W5 287 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 BBOF1Q8ND07 529 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PIGOQ8TEQ8 1089 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CLEC4DQ8WXI8 215 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SLCO2A1Q92959 643 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 VCPIP1Q96JH7 1222 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FAM167AQ96KS9 214 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NT5C1BQ96P26 610 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 RMDN3Q96TC7 470 aa8.54□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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