RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581180.1

MKS1-210, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKS1, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-210ENST00000581180 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 LHX5Q9H2C1 402 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 ASAH2Q9NR71 780 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 COMMD8Q9NX08 183 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 THEGQ9P2T0 379 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 CYTH4Q9UIA0 394 aa15.95■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 FAM92AA1XBS5 289 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 MOSPD3O75425 235 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 GABBR2O75899 941 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 ADCY5O95622 1261 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 F11P03951 625 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 MMEP08473 750 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 CCDC172P0C7W6 258 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 KRT9P35527 623 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 CCR2P41597 374 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 KIF11P52732 1056 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 SLC8A3P57103 927 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 FMO1Q01740 532 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 CDR2Q01850 454 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 ASIC2Q16515 512 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 SLC5A9Q2M3M2 681 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 TAF3Q5VWG9 929 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 PMF1Q6P1K2 205 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 GAREM2Q75VX8 874 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 TMEM150AQ86TG1 271 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 LEMD2Q8NC56 503 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 KCTD13Q8WZ19 329 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 NECTIN4Q96NY8 510 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 POMKQ9H5K3 350 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 GRPEL1Q9HAV7 217 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 USP3Q9Y6I4 520 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 CLUHO75153 1309 aa15.94■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 TADA3O75528 432 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 CDC25BP30305 580 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 HGSNATQ68CP4 663 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 STK32AQ8WU08 396 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 HSFY1Q96LI6 401 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 SLC4A5Q9BY07 1137 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 EHD2Q9NZN4 543 aa15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 HELZP42694 1942 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 MFAP3LO75121 409 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 MYL4P12829 197 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 YWHAQP27348 245 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 RGS7P49802 495 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 GOLGA8FQ08AF8 430 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 TAF10Q12962 218 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 TAF12Q16514 161 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 CYP4A22Q5TCH4 519 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 POTEHQ6S545 545 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 PASD1Q8IV76 773 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 ITFG1Q8TB96 612 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 SHKBP1Q8TBC3 707 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 DNAJC7Q99615 494 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 AGPAT1Q99943 283 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 HAUS4Q9H6D7 363 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 CYLDQ9NQC7 956 aa15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 ZNF197O14709 1029 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 FGF19O95750 216 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 LSM8O95777 96 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 TPM1P09493 284 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 SKILP12757 684 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 IL9P15248 144 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 FSHRP23945 695 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 GABRR2P28476 465 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 CDC25CP30307 473 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 KCNQ1P51787 676 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 NOMO3P69849 1222 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 KLHL30Q0D2K2 578 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 PDCLQ13371 301 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 WDR59Q6PJI9 974 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 TMEM110Q86TL2 294 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 SCML4Q8N228 414 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.91■□□□□ 0.14
MKS1-210ENST00000581180 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms