RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 GPBP1Q86WP2 473 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 C12orf40Q86WS4 652 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 NAXDQ8IW45 347 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 CPQQ9Y646 472 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 CACNA1EQ15878 2313 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 TISP43B9A030 160 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF217O75362 1048 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 ABL1P00519 1130 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 ITGB3P05106 788 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 ADH5P11766 374 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 GNSP15586 552 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 GABRG2P18507 467 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 ANXA13P27216 316 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 GRIK1P39086 918 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF131P52739 623 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SLC7A9P82251 487 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 GTF2BQ00403 316 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC142Q17RM4 750 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 RHBDF2Q6PJF5 856 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 OSTM1Q86WC4 334 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 TRIML1Q8N9V2 468 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SPATA17Q96L03 361 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 HSPA12BQ96MM6 686 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 PKMYT1Q99640 499 aa9.75□□□□□ -0.85
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PTPRM-210ENST00000578916 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 EHD2Q9NZN4 543 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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PTPRM-210ENST00000578916 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFS2O75306 463 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 TBCAO75347 108 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 GJB3O75712 270 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 KRT19P08727 400 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 HOXB2P14652 356 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 WASP42768 502 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 PPP3CCP48454 512 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 GAD2Q05329 585 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 POSTNQ15063 836 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SDE2Q6IQ49 451 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 FAM171BQ6P995 826 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 VSTM1Q6UX27 236 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 SLCO6A1Q86UG4 719 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 ADGRF2Q8IZF7 708 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 LRRC52Q8N7C0 313 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 NAT16Q8N8M0 369 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 POMGNT1Q8WZA1 660 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 CEP295NLQ96MC4 621 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 RNF38Q9H0F5 515 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 TBC1D14Q9P2M4 693 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 DEC1Q9P2X7 70 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-210ENST00000578916 GABRDO14764 452 aa9.73□□□□□ -0.85
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