RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 CNPY3Q9BT09 278 aa21.62■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 CARNS1A5YM72 827 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 DPYSL4O14531 572 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 GRAP2O75791 330 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 FGGP02679 453 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 TKTL1P51854 596 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 COL4A6Q14031 1691 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 SLC39A12Q504Y0 691 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 KATNAL2Q8IYT4 538 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 TSC1Q92574 1164 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 ZNF558Q96NG5 402 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.61■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 VWA8A3KMH1 1905 aa21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 ALPK3Q96L96 1907 aa21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 ZBBXA8MT70 800 aa21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 FGBP02675 491 aa21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 SDC4P31431 198 aa21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 OTOP2Q7RTS6 562 aa21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 MMGT1Q8N4V1 131 aa21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 CLEC4CQ8WTT0 213 aa21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 TTPALQ9BTX7 342 aa21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 SART1O43290 800 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 HSF2BPO75031 334 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 OR4Q2P0C623 313 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 PYGMP11217 842 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 LAG3P18627 525 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 FLT3P36888 993 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 CETN2P41208 172 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 CACNA2D1P54289 1103 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 ODF2Q5BJF6 829 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 ARCQ7LC44 396 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 BADQ92934 168 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 KCNK16Q96T55 309 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 YME1L1Q96TA2 773 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 NCAPGQ9BPX3 1015 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.59■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 KRIT1O00522 736 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 KRT1P04264 644 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 KRT7P08729 469 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 TAF5Q15542 800 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 EXD1Q8NHP7 514 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 IGSF21Q96ID5 467 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 B3GALT6Q96L58 329 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 PTPRDP23468 1912 aa21.58■■□□□ 1.05
CTU2-208ENST00000566637 CCDC188H7C350 402 aa21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 LRCH4O75427 683 aa21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 DAB1O75553 588 aa21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 ADCY1Q08828 1119 aa21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 RAB41Q5JT25 222 aa21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 TRNP1Q6NT89 227 aa21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 AADACL2Q6P093 401 aa21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 FAM149B1Q96BN6 582 aa21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa21.58■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 HHLA1C9JL84 531 aa21.57■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 34.2
CTU2-208ENST00000566637 GLI1P08151 1106 aa21.57■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.57■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 CPB1P15086 417 aa21.57■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 PCK1P35558 622 aa21.57■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 GRIK1P39086 918 aa21.57■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 PTPN9P43378 593 aa21.57■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 RABGGTBP53611 331 aa21.57■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 USP41Q3LFD5 358 aa21.57■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 CCDC14Q49A88 953 aa21.57■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 RTP2Q5QGT7 225 aa21.57■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CTU2-208ENST00000566637 ZNF365Q70YC5 407 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms