RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-208ENST00000563857 ABL1P00519 1130 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 PAEPP09466 180 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 VDRP11473 427 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ADORA2BP29275 332 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 RPS9P46781 194 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 SLC5A3P53794 718 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 MAP3K7CLP57077 242 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 SLC7A9P82251 487 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 GCNT1Q02742 428 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 GOLGA8FQ08AF8 430 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 LRRC32Q14392 662 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 PPP2R5DQ14738 602 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC142Q17RM4 750 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 HECTD3Q5T447 861 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 SNX30Q5VWJ9 437 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 POTEHQ6S545 545 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 CREBRFQ8IUR6 639 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ARHGAP18Q8N392 663 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC26Q8TAB7 109 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 FAM3CQ92520 227 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 LTB4R2Q9NPC1 389 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.316e-6■■■■■ 48.1
RNPS1-208ENST00000563857 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 GKN1Q9NS71 199 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 FAM49BQ9NUQ9 324 aa16.99■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF318Q5VUA4 2279 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 FAM92AA1XBS5 289 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 TNFRSF10BO14763 440 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 PRAMEF12O95522 483 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 TPM2P07951 284 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 CCDC130P13994 396 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 PLA2G5P39877 138 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 IFNAR2P48551 515 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 SGO2Q562F6 1265 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 DGKKQ5KSL6 1271 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 PPM1KQ8N3J5 372 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 CPA6Q8N4T0 437 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 C12orf29Q8N999 325 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ANKRD52Q8NB46 1076 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 WHAMMQ8TF30 809 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 TATDN2Q93075 761 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ATP2A3Q93084 1043 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 KCNK16Q96T55 309 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 SMOQ99835 787 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 NACA2Q9H009 215 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 GCNT4Q9P109 453 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.98■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 MUC3AQ02505 3323 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 TADA3O75528 432 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 RAD23BP54727 409 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 USP46P62068 366 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 RUNX3Q13761 415 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 MTF1Q14872 753 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF394Q53GI3 561 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 SASS6Q6UVJ0 657 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 GBP6Q6ZN66 633 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 SYNPOQ8N3V7 929 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 SLC4A11Q8NBS3 891 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 CLDN23Q96B33 292 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 HMGXB4Q9UGU5 601 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 SCML2Q9UQR0 700 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 PTPRDP23468 1912 aa16.97■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ARNTLO00327 626 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 NFATC1O95644 943 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 OLFM2O95897 454 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 OAS1P00973 400 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 RALAP11233 206 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 CD19P15391 556 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 PTMSP20962 102 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 BCAT1P54687 386 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 MFAP3P55082 362 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 LRMPQ12912 555 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ORC1Q13415 861 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 CLEC20AQ6ZU45 233 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF276Q8N554 614 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 SH3RF2Q8TEC5 729 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 OSCP1Q8WVF1 389 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ELMO3Q96BJ8 720 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 OTUB2Q96DC9 234 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 RSPRY1Q96DX4 576 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 TWNKQ96RR1 684 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 FAM83CQ9BQN1 747 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 ANO10Q9NW15 660 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.96■□□□□ 0.31
RNPS1-208ENST00000563857 E2F8A0AVK6 867 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 C2orf78A6NCI8 922 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa16.95■□□□□ 0.3
RNPS1-208ENST00000563857 PI15O43692 258 aa16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms