RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 MYH10P35580 1976 aa25.95■■□□□ 1.75
PRKCH-216ENST00000555542 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 CETN3O15182 167 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 AP1G2O75843 785 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 CCDC130P13994 396 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 ENPEPQ07075 957 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 CCINQ13939 588 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 WDR44Q5JSH3 913 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 UNC93AQ86WB7 457 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 SYNPOQ8N3V7 929 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 PDZD8Q8NEN9 1154 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 GSDMAQ96QA5 445 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 ECT2Q9H8V3 914 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 FAM49BQ9NUQ9 324 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.95■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 PRCPP42785 496 aa25.94■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 NR1H3Q13133 447 aa25.94■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 FUKQ8N0W3 1084 aa25.94■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 SLC2A14Q8TDB8 520 aa25.94■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 RUBCNQ92622 972 aa25.94■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 NELL1Q92832 810 aa25.94■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.94■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.94■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 SMPD4Q9NXE4 827 aa25.94■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 NCDNQ9UBB6 729 aa25.94■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 LEFTY2O00292 366 aa25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 CD58P19256 250 aa25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 GJA4P35212 333 aa25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 SLC5A3P53794 718 aa25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM196Q5HYL7 178 aa25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 KRT39Q6A163 491 aa25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 PAQR9Q6ZVX9 377 aa25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 SUMF1Q8NBK3 374 aa25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 P2RY13Q9BPV8 354 aa25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 NIF3L1Q9GZT8 377 aa25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 CPQQ9Y646 472 aa25.93■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 STX10O60499 249 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 LILRB5O75023 590 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 NFATC1O95644 943 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 TCF3P15923 654 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 ADORA2BP29275 332 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 GTF2H1P32780 548 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 MXI1P50539 228 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 EML3Q32P44 896 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 TCERG1LQ5VWI1 586 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 FSTL4Q6MZW2 842 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 CRYBG2Q8N1P7 616 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 SCAMP5Q8TAC9 235 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 NT5C1AQ9BXI3 368 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 RNF38Q9H0F5 515 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 CYP3A43Q9HB55 503 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.92■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 OAS1P00973 400 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 TDGF1P13385 188 aa25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 MAP3K7CLP57077 242 aa25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 SLC7A9P82251 487 aa25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 C12orf29Q8N999 325 aa25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 OVCA2Q8WZ82 227 aa25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 TIGD1Q96MW7 591 aa25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 NACA2Q9H009 215 aa25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 EPC1Q9H2F5 836 aa25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 RAB23Q9ULC3 237 aa25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 FAM186AA6NE01 2351 aa25.91■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 EGFP01133 1207 aa25.9■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 FAM200BP0CF97 657 aa25.9■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 DRD1P21728 446 aa25.9■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 GALK1P51570 392 aa25.9■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 INCA1Q0VD86 236 aa25.9■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 STIM1Q13586 685 aa25.9■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 KIAA2013Q8IYS2 634 aa25.9■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 CD101Q93033 1021 aa25.9■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.9■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 CHFRQ96EP1 664 aa25.9■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 LINC00597Q9H2U6 94 aa25.9■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa25.89■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 ATG13O75143 517 aa25.89■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 OLFM2O95897 454 aa25.89■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 FNTBP49356 437 aa25.89■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 ZXDBP98169 803 aa25.89■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 HECTD3Q5T447 861 aa25.89■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 PRR23BQ6ZRT6 265 aa25.89■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.89■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 DCLK2Q8N568 766 aa25.89■■□□□ 1.74
PRKCH-216ENST00000555542 FBXL13Q8NEE6 735 aa25.89■■□□□ 1.74
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