RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552440.5

USP44-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, human

TSL 5 BASIC

Gene USP44, Length 1,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP44-208	ENST00000552440	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	TMEM237	Q96Q45	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	TWNK	Q96RR1	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	WRNIP1	Q96S55	665 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ZNF536	O15090	1300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	TXNL1	O43396	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	STAM2	O75886	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	NTRK1	P04629	796 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	MME	P08473	750 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ARL3	P36405	182 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	CD151	P48509	253 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	PRKAA2	P54646	552 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	RAD23A	P54725	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ZXDA	P98168	799 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	EPS8	Q12929	822 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	KYNU	Q16719	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440		Q8NFD4	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	KAT5	Q92993	513 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	EXOC4	Q96A65	974 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440		H3BNC9	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ACOT7	O00154	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	TBX10	O75333	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	BBOX1	O75936	387 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	SNX4	O95219	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	MYL4	P12829	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	LAMP2	P13473	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	TFEB	P19484	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	TGM1	P22735	817 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	WAS	P42768	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	PPP5C	P53041	499 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	LGALS4	P56470	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ACTR2	P61160	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	HERVK_113	P62684	666 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	NKX3-2	P78367	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	IL10RA	Q13651	578 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP44-208	ENST00000552440	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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