RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 AIPL1Q9NZN9 384 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 MAP10Q9P2G4 905 aa8.39□□□□□ -1.07
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PTPRB-209ENST00000550857 DENND1AQ8TEH3 1009 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 RIT1Q92963 219 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 TTC17Q96AE7 1141 aa8.37□□□□□ -1.07
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PTPRB-209ENST00000550857 FGD4Q96M96 766 aa8.37□□□□□ -1.07
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