RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 KPNA6O60684 536 aa21.97■■□□□ 1.11
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PRDM4-205ENST00000550376 GDF10P55107 478 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM4-205ENST00000550376 MTM1Q13496 603 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM4-205ENST00000550376 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.97■■□□□ 1.11
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PRDM4-205ENST00000550376 RFX6Q8HWS3 928 aa21.97■■□□□ 1.11
PRDM4-205ENST00000550376 TTC39CQ8N584 583 aa21.97■■□□□ 1.11
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PRDM4-205ENST00000550376 POLNQ7Z5Q5 900 aa21.96■■□□□ 1.11
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PRDM4-205ENST00000550376 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.95■■□□□ 1.11
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PRDM4-205ENST00000550376 RIPK2O43353 540 aa21.95■■□□□ 1.1
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PRDM4-205ENST00000550376 THP07101 528 aa21.94■■□□□ 1.1
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PRDM4-205ENST00000550376 C1orf228Q6PIY5 440 aa21.93■■□□□ 1.1
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PRDM4-205ENST00000550376 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.93■■□□□ 1.1
PRDM4-205ENST00000550376 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.93■■□□□ 1.1
PRDM4-205ENST00000550376 GBP1P32455 592 aa21.93■■□□□ 1.1
PRDM4-205ENST00000550376 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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