RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-210ENST00000549362 NLRP5P59047 1200 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 IL13RA1P78552 427 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 CUL4BQ13620 913 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 IL10RAQ13651 578 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 KCNJ12Q14500 433 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 SPA17Q15506 151 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 MAN2A1Q16706 1144 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 CAVIN4Q5BKX8 364 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 TCP11X2Q5H9J9 407 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 FKBP15Q5T1M5 1219 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 GBP6Q6ZN66 633 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 ATG14Q6ZNE5 492 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 KIAA1328Q86T90 577 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 RHOT1Q8IXI2 618 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 SLC35F6Q8N357 371 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 RASSF8Q8NHQ8 419 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 PPM1EQ8WY54 764 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 GJA10Q969M2 543 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 ZSWIM3Q96MP5 696 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 WRNIP1Q96S55 665 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 CGRRF1Q99675 332 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 CRACR2AQ9BSW2 395 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 BRIP1Q9BX63 1249 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 LRRC27Q9C0I9 530 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 ARMT1Q9H993 441 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 GJB4Q9NTQ9 266 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 INTS13Q9NVM9 706 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 VPS18Q9P253 973 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 L1RE1Q9UN81 338 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 SAR1BQ9Y6B6 198 aa4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 DISP2A7MBM2 1401 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 CAPN8A6NHC0 703 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 LGALS16A8MUM7 142 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 GOLGA8KD6RF30 607 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 PES1O00541 588 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 FOXN1O15353 648 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 TEX33O43247 280 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 DAPK3O43293 454 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 ORC4O43929 436 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 AKR1B10O60218 316 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 MGEA5O60502 916 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 TACC1O75410 805 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 TCEA3O75764 348 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 CYP7B1O75881 506 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 FSBPO95073 299 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 NDUFA10O95299 355 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 RPN1P04843 607 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 ALDH2P05091 517 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 C8BP07358 591 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 ADRB1P08588 477 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 MED14OSP0DP75 135 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 SCG2P13521 617 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 USP8P40818 1118 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 PRPHP41219 470 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 MC3RP41968 323 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 PAFAH1B1P43034 410 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 EIF5P55010 431 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 NCKAP1LP55160 1127 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 PER3P56645 1201 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 APBA1Q02410 837 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 UBXN1Q04323 297 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 ITIH3Q06033 890 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 GOLGA8FQ08AF8 430 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 KIF5AQ12840 1032 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 RAPGEF1Q13905 1077 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 CASP8Q14790 479 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 KRT31Q15323 416 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 LONRF1Q17RB8 773 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 SPECC1Q5M775 1068 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 RNF220Q5VTB9 566 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 NPNTQ6UXI9 565 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 RAD9BQ6WBX8 426 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 SRLQ86TD4 932 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 TTC7BQ86TV6 843 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 RSPH3Q86UC2 560 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 FAM129CQ86XR2 697 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 DNAJC10Q8IXB1 793 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 FAM186BQ8IYM0 893 aa4.73□□□□□ -1.65
USP25-210ENST00000549362 GPR156Q8NFN8 814 aa4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms