RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542337.5

DDB1-220, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene DDB1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-220ENST00000542337 FBXO32Q969P5 355 aa21.49■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 LEFTY2O00292 366 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 HLA-DRAP01903 254 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 FNTBP49356 437 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 GALK1P51570 392 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 CACNA2D1P54289 1103 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 EML3Q32P44 896 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 FAM35AQ86V20 835 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 CCDC26Q8TAB7 109 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 OVCA2Q8WZ82 227 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 COMMD8Q9NX08 183 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.48■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 AP1G2O75843 785 aa21.47■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 AKAP3O75969 853 aa21.47■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 HOXA6P31267 233 aa21.47■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 GCLMP48507 274 aa21.47■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 NDST1P52848 882 aa21.47■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 WDR44Q5JSH3 913 aa21.47■■□□□ 1.03
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DDB1-220ENST00000542337 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.47■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.47■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 CD101Q93033 1021 aa21.47■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.47■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 KCNK16Q96T55 309 aa21.47■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 SDCBP2Q9H190 292 aa21.47■■□□□ 1.03
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DDB1-220ENST00000542337 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 K7ESF4 209 aa21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 CETN3O15182 167 aa21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 STX10O60499 249 aa21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 SMC2O95347 1197 aa21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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DDB1-220ENST00000542337 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 RNF38Q9H0F5 515 aa21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 LINC00597Q9H2U6 94 aa21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 KRT82Q9NSB4 513 aa21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 CPQQ9Y646 472 aa21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa21.46■■□□□ 1.03
DDB1-220ENST00000542337 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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DDB1-220ENST00000542337 TRIM49CP0CI26 452 aa21.45■■□□□ 1.02
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DDB1-220ENST00000542337 SLC5A3P53794 718 aa21.45■■□□□ 1.02
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DDB1-220ENST00000542337 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.45■■□□□ 1.02
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DDB1-220ENST00000542337 CHFRQ96EP1 664 aa21.45■■□□□ 1.02
DDB1-220ENST00000542337 TSG101Q99816 390 aa21.45■■□□□ 1.02
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DDB1-220ENST00000542337 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.45■■□□□ 1.02
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DDB1-220ENST00000542337 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.026e-9■■■■■ 58.7
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DDB1-220ENST00000542337 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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DDB1-220ENST00000542337 ASPAP45381 313 aa21.44■■□□□ 1.02
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DDB1-220ENST00000542337 KRT39Q6A163 491 aa21.44■■□□□ 1.02
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DDB1-220ENST00000542337 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.44■■□□□ 1.02
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DDB1-220ENST00000542337 LPAL2Q16609 132 aa21.43■■□□□ 1.02
DDB1-220ENST00000542337 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.43■■□□□ 1.02
DDB1-220ENST00000542337 WDR5BQ86VZ2 330 aa21.43■■□□□ 1.02
DDB1-220ENST00000542337 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
DDB1-220ENST00000542337 TTC39CQ8N584 583 aa21.43■■□□□ 1.02
DDB1-220ENST00000542337 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.43■■□□□ 1.02
DDB1-220ENST00000542337 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.43■■□□□ 1.02
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