RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 TFDP1Q14186 410 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 ACAD10Q6JQN1 1059 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 SLC39A4Q6P5W5 647 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 PASD1Q8IV76 773 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 HELQQ8TDG4 1101 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 GRK7Q8WTQ7 553 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 POMGNT1Q8WZA1 660 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 MCUR1Q96AQ8 359 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 FAM161BQ96MY7 647 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 NDNQ99608 321 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 STRA6Q9BX79 667 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 MYADML2A6NDP7 307 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 MAP3K7O43318 606 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 SLC26A4O43511 780 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 LMNAP02545 664 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 KRT5P13647 590 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 GLRA2P23416 452 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 CCNFP41002 786 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 GRIA2P42262 883 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 SCNN1BP51168 640 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 CAV1Q03135 178 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 ARHGAP1Q07960 439 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 GPS1Q13098 491 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 MSS51Q4VC12 460 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 TREML1Q86YW5 311 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 CCDC89Q8N998 374 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 SKA1Q96BD8 255 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 CFAP57Q96MR6 1250 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 TINF2Q9BSI4 451 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 SYNCQ9H7C4 482 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 SAR1AQ9NR31 198 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 H3BRJ5 948 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 PGK1P00558 417 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 SLC10A3P09131 477 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 RFX1P22670 979 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 ARSEP51690 589 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 FKBP1BP68106 108 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 TTLL4Q14679 1199 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 LRRC36Q1X8D7 754 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 XKR3Q5GH77 459 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 FYB2Q5VWT5 728 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 RELL1Q8IUW5 271 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 STMN2Q93045 179 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 NSL1Q96IY1 281 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 CDHR1Q96JP9 859 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 HAPLN2Q9GZV7 340 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 MINDY3Q9H8M7 445 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 SETD4Q9NVD3 440 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 PPM1HQ9ULR3 514 aa9.55□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 A6NJR5 290 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 MAFGO15525 162 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 OR6B1O95007 311 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 INSRRP14616 1297 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 BGNP21810 368 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 ICAM3P32942 547 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 ARFIP2P53365 341 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 INHBCP55103 352 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 ARL4CP56559 192 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 ZBTB16Q05516 673 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 HIC1Q14526 733 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 RASIP1Q5U651 963 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 ANKRD22Q5VYY1 191 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 RAPH1Q70E73 1250 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 RNF149Q8NC42 400 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 FAM81AQ8TBF8 368 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 FAM210AQ96ND0 272 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 PANX3Q96QZ0 392 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 TTC1Q99614 292 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 FCHO1O14526 889 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 LGALS2P05162 132 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 ENO1P06733 434 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 GSTA2P09210 222 aa9.54□□□□□ -0.88
THBS3-211ENST00000541990 IQCF3P0C7M6 154 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms