RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 GKN1Q9NS71 199 aa20.55■□□□□ 0.88
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CD27-AS1-208ENST00000538616 SYT15Q9BQS2 421 aa20.52■□□□□ 0.88
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CD27-AS1-208ENST00000538616 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 EGFP01133 1207 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM49P0CI25 452 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM49CP0CI26 452 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCSK1P29120 753 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 VAMP7P51809 220 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 AP3M2P53677 418 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 LMAN2Q12907 356 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 NCOA4Q13772 614 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 VEPH1Q14D04 833 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 PMS2CLQ68D20 193 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
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CD27-AS1-208ENST00000538616 EML5Q05BV3 1969 aa20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATICP31939 592 aa20.5■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 DGKEP52429 567 aa20.5■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDH8P55286 799 aa20.5■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 DMC1Q14565 340 aa20.5■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDR2Q16832 855 aa20.5■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF699Q32M78 642 aa20.5■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.5■□□□□ 0.87
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZACNQ401N2 412 aa20.5■□□□□ 0.87
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