RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538258.1

PGA3-204, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGA3, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-204ENST00000538258 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 ZMIZ2Q8NF64 920 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 FBXO32Q969P5 355 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 SLITRK1Q96PX8 696 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 FUCA2Q9BTY2 467 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 DUSP16Q9BY84 665 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 HESX1Q9UBX0 185 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 APEX2Q9UBZ4 518 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 KIAA1257Q9ULG3 409 aa9.6□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 SOBPA7XYQ1 873 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 BECN2A8MW95 431 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 DPYSL4O14531 572 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 TNFRSF10BO14763 440 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 TADA3O75528 432 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 ABL1P00519 1130 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 ZNF18P17022 549 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 FCARP24071 287 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 AVPR1AP37288 418 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 USP8P40818 1118 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 VIPR2P41587 438 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 PPP3CCP48454 512 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 SLC8A3P57103 927 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 TAF10Q12962 218 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 TXNDC8Q6A555 127 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 MON1AQ86VX9 555 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 ANKRD52Q8NB46 1076 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 SCAMP5Q8TAC9 235 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 E2F7Q96AV8 911 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 TRPV4Q9HBA0 871 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 SIX2Q9NPC8 291 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 COMMD8Q9NX08 183 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 TSPAN16Q9UKR8 245 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.59□□□□□ -0.87
PGA3-204ENST00000538258 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 HEPACAM2A8MVW5 462 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 HHLA1C9JL84 531 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 O00370 1275 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 PRAMEF12O95522 483 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 CALCAP01258 141 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 CFHP08603 1231 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 SRFP11831 508 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 WEE1P30291 646 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 ZNF132P52740 706 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 BCAT1P54687 386 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 BST2Q10589 180 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 KCNMA1Q12791 1236 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 GRM2Q14416 872 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 STILQ15468 1287 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 VITQ6UXI7 678 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 TTC30AQ86WT1 665 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 YAF2Q8IY57 180 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 UBA3Q8TBC4 463 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 TFAP2BQ92481 460 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 PDLIM2Q96JY6 352 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 PHOX2BQ99453 314 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 FBXO44Q9H4M3 255 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 PNPLA8Q9NP80 782 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 IL37Q9NZH6 218 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 GMIPQ9P107 970 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.58□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 C2orf78A6NCI8 922 aa9.57□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 TMEM221A6NGB7 291 aa9.57□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 LGALS16A8MUM7 142 aa9.57□□□□□ -0.88
PGA3-204ENST00000538258 M0QYV0 167 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms