RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	LTN1	O94822	1766 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089		A0A087WWL8	130 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RAB27B	O00194	218 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PODXL	O00592	558 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	INMT	O95050	263 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PRSS23	O95084	383 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CYP2C9	P11712	490 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	IDE	P14735	1019 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CHRM3	P20309	590 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	NHLH2	Q02577	135 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	BIRC3	Q13489	604 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	IQCB1	Q15051	598 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PNKP	Q96T60	521 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	LY75	O60449	1722 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089		E9PLN8	166 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	EXOC5	O00471	708 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CYP27B1	O15528	508 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PLAT	P00750	562 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	FCER1A	P12319	257 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TPH1	P17752	444 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	IL1R2	P27930	398 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	ITGA8	P53708	1063 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CRHR2	Q13324	411 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PRR16	Q569H4	304 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	METTL24	Q5JXM2	366 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TEPSIN	Q96N21	525 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	GPR87	Q9BY21	358 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.8	□□□□□ -1.64	2e-6	■■□□□ 12.9
MDM2-223	ENST00000536089	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	RAD54B	Q9Y620	910 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	EVC2	Q86UK5	1308 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MDM2-223	ENST00000536089	NFAT5	O94916	1531 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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