RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 PDXDC1Q6P996 788 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 WDR59Q6PJI9 974 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 RRAGAQ7L523 313 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 TMEM139Q8IV31 216 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 CNGA4Q8IV77 575 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 UBR7Q8N806 425 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 RNF169Q8NCN4 708 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 SHC3Q92529 594 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 JAKMIP2Q96AA8 810 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 PANX2Q96RD6 677 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 DNAJC7Q99615 494 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 NPHS2Q9NP85 383 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 IL23AQ9NPF7 189 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.56□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 COL4A6Q14031 1691 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 LRRC53A6NM62 1247 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 EFCAB14O75071 495 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 DDHD2O94830 711 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 POMCP01189 267 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 KRT19P08727 400 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 ACRP10323 421 aa6.55□□□□□ -1.36
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CMTM1-220ENST00000534143 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 SOX5P35711 763 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 PRKCIP41743 596 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 EPHB4P54760 987 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 MFAP3P55082 362 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 NOP14P78316 857 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 CBX1P83916 185 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 CDK17Q00537 523 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 DSC1Q08554 894 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 GRIK3Q13003 919 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
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CMTM1-220ENST00000534143 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 ARTNQ5T4W7 220 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 CD300LGQ6UXG3 332 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 BADQ92934 168 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 TOP1MTQ969P6 601 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 HPDLQ96IR7 371 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 FAM81BQ96LP2 452 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 MYRFLQ96LU7 910 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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CMTM1-220ENST00000534143 CHP1Q99653 195 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 BCO2Q9BYV7 579 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 SDCBP2Q9H190 292 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 PRO3102Q9H379 93 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 KCNF1Q9H3M0 494 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 OGFRQ9NZT2 677 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 STOML1Q9UBI4 398 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 RNF112Q9ULX5 631 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.55□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.54□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 F8VZ95 297 aa6.54□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 B4GALT3O60512 393 aa6.54□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 DGKIO75912 1065 aa6.54□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 BAIAP3O94812 1187 aa6.54□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 FGBP02675 491 aa6.54□□□□□ -1.36
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