RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533650.5

TATDN3-216, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene TATDN3, Length 417 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-216ENST00000533650 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 SLC23A3Q6PIS1 610 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 SV2BQ7L1I2 683 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 SFTPA1Q8IWL2 248 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 TMEFF1Q8IYR6 380 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 HPDLQ96IR7 371 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 SPACA7Q96KW9 195 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 INTS13Q9NVM9 706 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 LAMA5O15230 3695 aa16.56■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PCNX2A6NKB5 2137 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 UPK3BL1B0FP48 263 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 UPK3BL2E5RIL1 263 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 TRIM66O15016 1216 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 APODP05090 189 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PDGFRBP09619 1106 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 ANXA13P27216 316 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 TIE1P35590 1138 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 GRIA2P42262 883 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 CASP5P51878 434 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 CYP27A1Q02318 531 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 MESP2Q0VG99 397 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 MAP7D1Q3KQU3 841 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 EMC10Q5UCC4 262 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PIP4P1Q86T03 277 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 GPD1LQ8N335 351 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 FRMD1Q8N878 549 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PCED1BQ96HM7 432 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 C8orf48Q96LL4 319 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PILRBQ9UKJ0 227 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 CPQQ9Y646 472 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 GON4LQ3T8J9 2241 aa16.55■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 ADAM23O75077 832 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 OAS1P00973 400 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 ENGP17813 658 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 HOXD12P35452 270 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 MAPK8P45983 427 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 SEMA3BQ13214 749 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 SURF1Q15526 300 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 DUOXA2Q1HG44 320 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 SMC3Q9UQE7 1217 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 MSRB2Q9Y3D2 182 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PKD1L2Q7Z442 2459 aa16.54■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PTPRDP23468 1912 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 F8VP50 259 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 ADH1CP00326 375 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 ABL1P00519 1130 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 TNNC2P02585 160 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 FAM163BP0C2L3 166 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 TAF10Q12962 218 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 RESTQ13127 1097 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 LYSMD4Q5XG99 296 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 ARMCX6Q7L4S7 300 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 C12orf40Q86WS4 652 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 ARHGEF4Q9NR80 690 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 SMPD4Q9NXE4 827 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 CFAP97Q9P2B7 532 aa16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PTPRJQ12913 1337 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 E2F8A0AVK6 867 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 FAM221BA6H8Z2 402 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 ZNF233A6NK53 670 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 TACC1O75410 805 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 IDEP14735 1019 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 ITPKAP23677 461 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 DUOXA1Q1HG43 343 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 KIAA1211LQ6NV74 962 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 LRSAM1Q6UWE0 723 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PGBD3Q8N328 593 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 PHTF2Q8N3S3 785 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 CEP76Q8TAP6 659 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 HMGB4Q8WW32 186 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 SLITRK1Q96PX8 696 aa16.52■□□□□ 0.24
TATDN3-216ENST00000533650 MMS19Q96T76 1030 aa16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms