RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533644.5

BBS1-223, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 3

Gene BBS1, Length 910 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-223	ENST00000533644	CCDC130	P13994	396 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	HDC	P19113	662 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	RUNX3	Q13761	415 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	PDGFRL	Q15198	375 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	MED10	Q9BTT4	135 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	EBF3	Q9H4W6	596 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	IL37	Q9NZH6	218 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-223	ENST00000533644	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CILP	O75339	1184 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	YWHAQ	P27348	245 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	PPP1R2	P41236	205 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	SLC7A9	P82251	487 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	LRRC32	Q14392	662 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	C12orf29	Q8N999	325 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	WHAMM	Q8TF30	809 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	NELL1	Q92832	810 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CHFR	Q96EP1	664 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	SMO	Q99835	787 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	RAB20	Q9NX57	234 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644		R4GN57	208 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	FAM92A	A1XBS5	289 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	AP1G2	O75843	785 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	ARSA	P15289	507 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	BMP6	P22004	513 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	SLC5A3	P53794	718 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	ZXDB	P98169	803 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	STIM1	Q13586	685 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CCIN	Q13939	588 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	MORC3	Q14149	939 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	GAS6	Q14393	721 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CBWD6	Q4V339	395 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	RNF38	Q9H0F5	515 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	COMMD8	Q9NX08	183 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	BEST1	O76090	585 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	TDGF1	P13385	188 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CD58	P19256	250 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	PON2	Q15165	354 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	TTC39C	Q8N584	583 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	FBXO32	Q969P5	355 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	SLC35C1	Q96A29	364 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CEP63	Q96MT8	703 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	LEFTY2	O00292	366 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	FAM200B	P0CF97	657 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CCR3	P51677	355 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	EML3	Q32P44	896 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	ISM2	Q6H9L7	571 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	TTI2	Q6NXR4	508 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	CPA6	Q8N4T0	437 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	ATP2A3	Q93084	1043 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	ECT2	Q9H8V3	914 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-223	ENST00000533644	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		18.73	■□□□□ 0.59

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