RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524356.1

PCM1-223, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 2

Gene PCM1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-223	ENST00000524356	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PCM1-223	ENST00000524356	UNC13B	O14795	1591 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356		A0A087WV62	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	NCK2	O43639	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PCDH8	O95206	1070 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	POU2F2	P09086	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TGFB3	P10600	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	C5AR1	P21730	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TNFSF4	P23510	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PEX2	P28328	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	BTK	Q06187	659 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TERF2	Q15554	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PRKCG	P05129	697 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ETFDH	Q16134	617 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	EFHB	Q8N7U6	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TTC14	Q96N46	770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	LAMC1	P11047	1609 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	NUP155	O75694	1391 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356		H3BML4	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356		K7ENM7	598 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	KPNA5	O15131	536 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	APP	P05067	770 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	STT3A	P46977	705 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CASP5	P51878	434 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	PDCD1	Q15116	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	MIER2	Q8N344	545 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PCM1-223	ENST00000524356	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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