RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511947.2

AP001790.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AP001790.1, Length 570 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP001790.1-201ENST00000511947 SLC4A11Q8NBS3 891 aa15.87■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.87■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.87■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 SLC22A12Q96S37 553 aa15.87■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 FOXQ1Q9C009 403 aa15.87■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 COMMD8Q9NX08 183 aa15.87■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 PIAS3Q9Y6X2 628 aa15.87■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 ARNTLO00327 626 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 MAN2B1O00754 1011 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 PFKLP17858 780 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 CLEC20AQ6ZU45 233 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 PJA1Q8NG27 643 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 DUSP16Q9BY84 665 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 FBXO44Q9H4M3 255 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 THAP9Q9H5L6 903 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 GKN1Q9NS71 199 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 GCNT4Q9P109 453 aa15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 ZNF318Q5VUA4 2279 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 FAM170BA6NMN3 283 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 DCNP07585 359 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 GLULP15104 373 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 CD19P15391 556 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 SLC8A3P57103 927 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 TMEM270Q6UE05 265 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 SASS6Q6UVJ0 657 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 RRAGAQ7L523 313 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 IRF2BP1Q8IU81 584 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 TTC8Q8TAM2 541 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 LMO3Q8TAP4 145 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 NELL2Q99435 816 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 LTB4R2Q9NPC1 389 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 IL37Q9NZH6 218 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 GMIPQ9P107 970 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa15.85■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 ACO1P21399 889 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 PTPN5P54829 565 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 GCNT1Q02742 428 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 TNK2Q07912 1038 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 SGO2Q562F6 1265 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 ARHGEF19Q8IW93 802 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 PRSS33Q8NF86 280 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 MSANTD3Q96H12 275 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 CRACR2AQ9BSW2 395 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 GTSE1Q9NYZ3 720 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 KIAA1257Q9ULG3 409 aa15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
AP001790.1-201ENST00000511947 FAM92AA1XBS5 289 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 HHLA1C9JL84 531 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 NCAM2O15394 837 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 OAS1P00973 400 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 VDRP11473 427 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 SLC7A9P82251 487 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 MTF1Q14872 753 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 PDGFRLQ15198 375 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 ZNF77Q15935 545 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 HECTD3Q5T447 861 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 CCDC183Q5T5S1 534 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 GBP6Q6ZN66 633 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 UBR7Q8N806 425 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 FAM3CQ92520 227 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 KAT5Q92993 513 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 NACA2Q9H009 215 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 RNF38Q9H0F5 515 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 SMPD4Q9NXE4 827 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 HESX1Q9UBX0 185 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 SCML2Q9UQR0 700 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 CPQQ9Y646 472 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 PTPRDP23468 1912 aa15.83■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa15.82■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 CYP26A1O43174 497 aa15.82■□□□□ 0.12
AP001790.1-201ENST00000511947 COCHO43405 550 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms