RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 TEX264Q9Y6I9 313 aa28.27■■■□□ 2.12
SH3BP2-221ENST00000511747 AVILO75366 819 aa28.26■■■□□ 2.12
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SH3BP2-221ENST00000511747 WDR78Q5VTH9 848 aa28.23■■■□□ 2.11
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SH3BP2-221ENST00000511747 SPDL1Q96EA4 605 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM167AQ96KS9 214 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP2-221ENST00000511747 ADPGKQ9BRR6 497 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP2-221ENST00000511747 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
SH3BP2-221ENST00000511747 C2orf40Q9H1Z8 148 aa28.23■■■□□ 2.11
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