RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 HDCP19113 662 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 LRPAP1P30533 357 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SLC11A2P49281 568 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 PNLIPRP1P54315 467 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa2.5□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC30Q5VVM6 783 aa2.5□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 TUBP50607 506 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 EPS8Q12929 822 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 SLC12A1Q13621 1099 aa2.5□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa2.5□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
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PDE4D-218ENST00000509368 CDR1P51861 262 aa2.5□□□□□ -2.01
PDE4D-218ENST00000509368 NOMO3P69849 1222 aa2.5□□□□□ -2.01
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