RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496887.6

KCNQ1-205, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 5

Gene KCNQ1, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-205ENST00000496887 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 CLEC20AQ6ZU45 233 aa17.88■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PJA1Q8NG27 643 aa17.88■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 LMO3Q8TAP4 145 aa17.88■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa17.88■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 NT5C1BQ96P26 610 aa17.88■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 SLITRK1Q96PX8 696 aa17.88■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PRRX2Q99811 253 aa17.88■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 KIF9Q9HAQ2 790 aa17.88■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 IL37Q9NZH6 218 aa17.88■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 DCNP07585 359 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 HDCP19113 662 aa17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 NUBP1P53384 320 aa17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 IRF2BP1Q8IU81 584 aa17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 EHBP1Q8NDI1 1231 aa17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 RIN3Q8TB24 985 aa17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 FBXO32Q969P5 355 aa17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 JAKMIP2Q96AA8 810 aa17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 DACH1Q9UI36 760 aa17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PIAS3Q9Y6X2 628 aa17.87■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 SHISA7A6NL88 538 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM170BA6NMN3 283 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 HHLA1C9JL84 531 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PDE6CP51160 858 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PLCB2Q00722 1185 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 UBXN2BQ14CS0 331 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF852Q6ZMS4 543 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PPM1KQ8N3J5 372 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 UBR7Q8N806 425 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 TTC16Q8NEE8 873 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PDZD8Q8NEN9 1154 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 TTC8Q8TAM2 541 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 OVCA2Q8WZ82 227 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 DUSP16Q9BY84 665 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 RNF38Q9H0F5 515 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 LTB4R2Q9NPC1 389 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 GKN1Q9NS71 199 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 COMMD8Q9NX08 183 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 GTSE1Q9NYZ3 720 aa17.86■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM92AA1XBS5 289 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 MAN2B1O00754 1011 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PFKLP17858 780 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 SOX9P48436 509 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 TNK2Q07912 1038 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 TCF15Q12870 199 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 ZNF77Q15935 545 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGAP17Q68EM7 881 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 RRAGAQ7L523 313 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGEF19Q8IW93 802 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 CCDC105Q8IYK2 499 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 DTWD2Q8NBA8 298 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 KAT5Q92993 513 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 FAM83CQ9BQN1 747 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 THAP9Q9H5L6 903 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 GMIPQ9P107 970 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa17.85■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 OAS1P00973 400 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 GLULP15104 373 aa17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 TARSP26639 723 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PTPN5P54829 565 aa17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 ZXDBP98169 803 aa17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 MTF1Q14872 753 aa17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 TRIM68Q6AZZ1 485 aa17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 SH3RF2Q8TEC5 729 aa17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 NELL2Q99435 816 aa17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 OSBPL6Q9BZF3 934 aa17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 FBXO44Q9H4M3 255 aa17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PNPLA8Q9NP80 782 aa17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa17.84■□□□□ 0.45
KCNQ1-205ENST00000496887 OLFM2O95897 454 aa17.83■□□□□ 0.44
KCNQ1-205ENST00000496887 MBD3O95983 291 aa17.83■□□□□ 0.44
KCNQ1-205ENST00000496887 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa17.83■□□□□ 0.44
KCNQ1-205ENST00000496887 ACO1P21399 889 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
KCNQ1-205ENST00000496887 PGFP49763 221 aa17.83■□□□□ 0.44
KCNQ1-205ENST00000496887 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
KCNQ1-205ENST00000496887 SLC7A9P82251 487 aa17.83■□□□□ 0.44
KCNQ1-205ENST00000496887 USP4Q13107 963 aa17.83■□□□□ 0.44
KCNQ1-205ENST00000496887 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa17.83■□□□□ 0.44
KCNQ1-205ENST00000496887 SGO2Q562F6 1265 aa17.83■□□□□ 0.44
KCNQ1-205ENST00000496887 HECTD3Q5T447 861 aa17.83■□□□□ 0.44
KCNQ1-205ENST00000496887 SNX30Q5VWJ9 437 aa17.83■□□□□ 0.44
KCNQ1-205ENST00000496887 TMEM270Q6UE05 265 aa17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms