RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 NFS1Q9Y697 457 aa12.49□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCT8L1PA6NM43 557 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 M0QZQ0 153 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CES2O00748 559 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF844Q08AG5 666 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPRED3Q2MJR0 410 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 RTP2Q5QGT7 225 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 FAM171A1Q5VUB5 890 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPP2R2DQ66LE6 453 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CENPTQ96BT3 561 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM169Q96HH4 297 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 SH3GL3Q99963 347 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 BCO2Q9BYV7 579 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 GPR88Q9GZN0 384 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 NLRC4Q9NPP4 1024 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPG21Q9NZD8 308 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 EPOPA6NHQ4 379 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 RAD51CO43502 376 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 BUB1O43683 1085 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ATP2C2O75185 946 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CD58P19256 250 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 DNAJB1P25685 340 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ORC1Q13415 861 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC142Q17RM4 750 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 DSTYKQ6XUX3 929 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCDC63Q8NA47 563 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 TBC1D31Q96DN5 1066 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPAG5Q96R06 1193 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 HOMER3Q9NSC5 361 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 SALL4Q9UJQ4 1053 aa12.48□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ACO1P21399 889 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 DRD4P21917 467 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 GCNT1Q02742 428 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 RAB30Q15771 203 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARHGAP44Q17R89 818 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 MEI1Q5TIA1 1274 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 OSTM1Q86WC4 334 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 NSMCE1Q8WV22 266 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CHMP6Q96FZ7 201 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 TWNKQ96RR1 684 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 AAASQ9NRG9 546 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 MSRAQ9UJ68 235 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 DNAJC12Q9UKB3 198 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 C15orf41Q9Y2V0 281 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 LRRC53A6NM62 1247 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 PALMO75781 387 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 LMO2P25791 158 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 PPM1AP35813 382 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 RAPGEF1Q13905 1077 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ITIH4Q14624 930 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 LRIT3Q3SXY7 679 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ADGRF2Q8IZF7 708 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 UBR7Q8N806 425 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 APPL2Q8NEU8 664 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 AUTS2Q8WXX7 1259 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 TIFAQ96CG3 184 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPDL1Q96EA4 605 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 RTP3Q9BQQ7 232 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 SLC28A3Q9HAS3 691 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ACP6Q9NPH0 428 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CISHQ9NSE2 258 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa12.47□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 C5orf67F2Z3F1 127 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 HUS1O60921 280 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CALCAP01258 141 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ODC1P11926 461 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 FGFR3P22607 806 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ERVK-21P61565 698 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 BIRC2Q13490 618 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CAMK1Q14012 370 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 TOP6BLQ8N6T0 577 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 ARNTL2Q8WYA1 636 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 BAP1Q92560 729 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 LPIN3Q9BQK8 851 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 CHST7Q9NS84 486 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 TMEM59LQ9UK28 342 aa12.46□□□□□ -0.41
TIMMDC1-208ENST00000494664 KLHL33A6NCF5 533 aa12.45□□□□□ -0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 C2CD2LO14523 706 aa12.45□□□□□ -0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 GRM6O15303 877 aa12.45□□□□□ -0.42
TIMMDC1-208ENST00000494664 ANP32DO95626 131 aa12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms