RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, human

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCAMP4-208	ENST00000489554	FIGN	Q5HY92	759 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	GJB7	Q6PEY0	223 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	MYLPF	Q96A32	169 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	MSANTD3	Q96H12	275 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	BCO2	Q9BYV7	579 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	NCAN	O14594	1321 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM170B	A6NMN3	283 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	PROB1	E7EW31	1015 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATP2C2	O75185	946 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	CLSTN1	O94985	981 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	TPM2	P07951	284 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	P4HA1	P13674	534 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	AVPR1A	P37288	418 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	NBL1	P41271	181 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	PIK3CA	P42336	1068 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	TMC6	Q7Z403	805 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	UBR7	Q8N806	425 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	BAP1	Q92560	729 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	TAF4B	Q92750	862 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	KAT5	Q92993	513 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	TATDN2	Q93075	761 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	SPATA17	Q96L03	361 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	MYRFL	Q96LU7	910 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	PHOX2B	Q99453	314 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	EHD2	Q9NZN4	543 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SCAMP4-208	ENST00000489554		A8MXQ7	604 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARNTL	O00327	626 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TRIM66	O15016	1216 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	NRDC	O43847	1150 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	PRAMEF12	O95522	483 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	UCHL3	P15374	230 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CD72	P21854	359 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ANXA13	P27216	316 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ASPA	P45381	313 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	JAM2	P57087	298 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CYP27A1	Q02318	531 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CCDC142	Q17RM4	750 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	MON1A	Q86VX9	555 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	PCED1B	Q96HM7	432 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ARID3A	Q99856	593 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	SDCBP2	Q9H190	292 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62	2e-7	■■■■■ 67.3
SCAMP4-208	ENST00000489554	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ATP8B3	O60423	1300 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SCAMP4-208	ENST00000489554	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62

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