RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FAM131BQ86XD5 332 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 GANCQ8TET4 914 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 BTBD6Q96KE9 485 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FBXL18Q96ME1 805 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SERPINB11Q96P15 392 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 OGFRQ9NZT2 677 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NFU1Q9UMS0 254 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SQORQ9Y6N5 450 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 COL4A1P02462 1669 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 KCNN4O15554 427 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SLC4A1P02730 911 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PRLRP16471 622 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PBX1P40424 430 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MSH2P43246 934 aa8.64□□□□□ -1.03
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PTPRD-211ENST00000486161 P3H1Q32P28 736 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 IL31Q6EBC2 164 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SNF8Q96H20 258 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MUC3BQ9H195 1237 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 AMACRQ9UHK6 382 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.63□□□□□ -1.03
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PTPRD-211ENST00000486161 LTFP02788 710 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RBP3P10745 1247 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MYL4P12829 197 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 COPS2P61201 443 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC110Q8TBZ0 833 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGEF26Q96DR7 871 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF185O15231 689 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PJA2O43164 708 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PSMD3O43242 534 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ATP8B1O43520 1251 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB16Q05516 673 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FPGSQ05932 587 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 GEN1Q17RS7 908 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 C4orf22Q6V702 233 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 EXD1Q8NHP7 514 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SPPL2BQ8TCT7 592 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MS4A14Q96JA4 679 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TTC25Q96NG3 672 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ULBP1Q9BZM6 244 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MED4Q9NPJ6 270 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 STK25O00506 426 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PFKMP08237 780 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 GLUD2P49448 558 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PIGZQ86VD9 579 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MYLPFQ96A32 169 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CRCPO75575 148 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CSH1P0DML2 217 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CSH2P0DML3 217 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CAPN2P17655 700 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 PSEN1P49768 467 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LILRA4P59901 499 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 TRIM60Q495X7 471 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 CCT6BQ92526 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 EDEM1Q92611 657 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 RUBCNQ92622 972 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ZIC5Q96T25 663 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ABCC13Q9NSE7 274 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 MYH4Q9Y623 1939 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGAP42A6NI28 874 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-211ENST00000486161 SYN3O14994 580 aa8.62□□□□□ -1.03
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